52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0164 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0164  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  41.72 
 
 		 335 aa  265  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  39.73 
 
 		 291 aa  217  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  39.38 
 
 		 291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 		 301 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  30.64 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0280  beta-lactamase-like protein  29.45 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  22.99 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  28.48 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  23.21 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 279 aa  48.9  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  18.71 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  36.11 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  43.4 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  23.2 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  22.65 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  25.12 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  34.48 
 
 		 256 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.79 
 
 		 306 aa  45.8  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  23.44 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22660  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.89 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.662338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  22.22 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  42.59 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  20.63 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 206 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 		 552 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  42.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  21.89 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 		 212 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  23.41 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  23.27 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  24.3 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  22.77 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  27.08 
 
 		 215 aa  42.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.84 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  23.5 
 
 		 214 aa  42.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  23.27 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2033  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.5 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000269745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  27.08 
 
 		 215 aa  42.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.33 
 
 		 256 aa  42.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>