More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22660 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22660  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 214 aa  438  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.662338 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  38.12 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  37.24 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  33.97 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.86 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.93 
 
 		 198 aa  111  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.52 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.99 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  33.5 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  36.9 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  32.4 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  37.71 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  32.11 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  33.69 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.96 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  32.11 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  37.43 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.57 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  33 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.56 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  31.96 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  31.96 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  35.11 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  32.63 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  32.63 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  33.17 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  33.71 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.33 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.45 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  35.39 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  33.51 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  34.62 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  30.48 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  36.02 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 		 237 aa  98.2  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  30.22 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  30.35 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  30.22 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  30.93 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  33.52 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  32.6 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  30.93 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  34.66 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.47 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  29.8 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  29.8 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.3 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  29.8 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.3 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.3 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  31.87 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.3 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  29.8 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  31.38 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.3 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  29.8 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  29.8 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  29.8 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.15 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  28.86 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>