60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1594 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1594  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
313 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  26.3 
 
 
334 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  28.96 
 
 
363 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  26.51 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  25.16 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  26.51 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  26.51 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 
334 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 
329 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 
321 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  24.92 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  25.5 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  24.92 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  24.43 
 
 
259 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 
317 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  25.09 
 
 
315 aa  52.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  24.89 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 
354 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
329 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  23.21 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
207 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
207 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  22.43 
 
 
324 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  24.89 
 
 
260 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  23.18 
 
 
354 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  22.98 
 
 
257 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  23.28 
 
 
352 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  23.94 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  23.71 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3406  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.317826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 
339 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  25.53 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.45 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  27.37 
 
 
201 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  23.53 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0657  beta-lactamase domain-containing protein  22.56 
 
 
207 aa  43.5  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  32 
 
 
213 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  24.09 
 
 
207 aa  42.7  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 
323 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  24.15 
 
 
260 aa  42.7  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
304 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>