More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5001 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 350 aa  713    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  35.97 
 
 		 276 aa  176  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  40.5 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  40 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  30.51 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  35.9 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  27.97 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  30.65 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  34.38 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  34.44 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  29.94 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  25.33 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  32.21 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  29.5 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  29.5 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  30.71 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.94 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.19 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  33.6 
 
 		 214 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 210 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  29.68 
 
 		 234 aa  57  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 212 aa  57  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 207 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  29.84 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  29.32 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  29.32 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  29.84 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 214 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  29.32 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  36.19 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  34.43 
 
 		 200 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.11 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  37.88 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  31.2 
 
 		 237 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 209 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  31.11 
 
 		 212 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 208 aa  53.1  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  27.23 
 
 		 237 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 211 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  35.16 
 
 		 217 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 		 235 aa  53.1  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 		 214 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  28.35 
 
 		 259 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.63 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  36.99 
 
 		 324 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 		 214 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 		 201 aa  52.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  31.2 
 
 		 241 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.78 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  37.04 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 		 244 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1778  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0392485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 		 198 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  31.16 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  35.24 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  27.37 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.72 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.66 
 
 		 215 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  31.73 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.2 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 		 209 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.68 
 
 		 215 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  32.28 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 202 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.66 
 
 		 215 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.66 
 
 		 215 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.66 
 
 		 215 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.66 
 
 		 215 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  33.91 
 
 		 201 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  27.89 
 
 		 211 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 207 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>