195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4017 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  100 
 
 		 293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  99.32 
 
 		 293 aa  597  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  98.98 
 
 		 293 aa  594  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  98.98 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  98.63 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  63.54 
 
 		 298 aa  337  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  40.21 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  36.02 
 
 		 290 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  35.14 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  36.72 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  32.45 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  31.76 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  32.47 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  31.13 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  23.51 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  29.48 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 		 230 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  26.78 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  23.9 
 
 		 363 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  27.52 
 
 		 209 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  27.53 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  26.26 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 230 aa  52.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 205 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 215 aa  52.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  27.17 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  25.43 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  30.66 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  23.7 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.03 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  23.26 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  30.19 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  25.62 
 
 		 215 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  22.82 
 
 		 201 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  25.62 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  28.29 
 
 		 222 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  27.89 
 
 		 217 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  27.33 
 
 		 327 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1866  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.81 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  26.62 
 
 		 348 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 		 307 aa  48.9  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.12 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.12 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.37 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  27.46 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.12 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.12 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.12 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  25 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  28.1 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  25.9 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  23.42 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  27.71 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  22.12 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  26.35 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>