44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3880 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  42.91 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  39.02 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  34.7 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  35.25 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  32.45 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  31.79 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  32.45 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  32.45 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  33.46 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  32.43 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  33.09 
 
 		 288 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  34.4 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  32.23 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  31.42 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  34.44 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  27.33 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 		 205 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  26.09 
 
 		 207 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 251 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.43 
 
 		 213 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  35.58 
 
 		 213 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  22.97 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.43 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 212 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  27.03 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  31.43 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  32.04 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  32.04 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 		 198 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  30.07 
 
 		 239 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  28.85 
 
 		 209 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  29.22 
 
 		 212 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  29.25 
 
 		 239 aa  42.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  23.78 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  28.18 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>