235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2974 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  94.69 
 
 
359 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  85.24 
 
 
383 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  94.41 
 
 
359 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  95.25 
 
 
359 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
384 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  95.49 
 
 
359 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  95.25 
 
 
359 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  97.77 
 
 
358 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  85.2 
 
 
359 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  85.2 
 
 
359 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  85.2 
 
 
359 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  85.2 
 
 
359 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  84.64 
 
 
359 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  87.08 
 
 
326 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  84.55 
 
 
331 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  81.13 
 
 
356 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  78.37 
 
 
357 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  78.21 
 
 
357 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  68.52 
 
 
359 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  68.52 
 
 
359 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  67.03 
 
 
359 aa  494  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  66.29 
 
 
359 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  63.66 
 
 
357 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  64.01 
 
 
358 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  55.21 
 
 
359 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  55.62 
 
 
361 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  59.67 
 
 
363 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  51.54 
 
 
394 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  56.79 
 
 
362 aa  401  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  56.46 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  50.71 
 
 
341 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  47.88 
 
 
342 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  48.43 
 
 
344 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  44.32 
 
 
371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  44.76 
 
 
365 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  40.97 
 
 
354 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  41.37 
 
 
400 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  41.11 
 
 
354 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  41.04 
 
 
354 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  40.67 
 
 
354 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  42.82 
 
 
357 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  41.19 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  40.36 
 
 
343 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  42.05 
 
 
349 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  38.08 
 
 
348 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  39.28 
 
 
352 aa  245  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  43.02 
 
 
363 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  42.61 
 
 
365 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  42 
 
 
374 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  40.12 
 
 
369 aa  222  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  38.1 
 
 
354 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  35.75 
 
 
349 aa  207  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.57 
 
 
344 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 
344 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  37.22 
 
 
344 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  36.78 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  36.18 
 
 
329 aa  196  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
335 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  36.16 
 
 
349 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
321 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 
321 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  32.15 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 
324 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 
324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 
331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  31.33 
 
 
353 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  31.82 
 
 
331 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 
324 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  31.33 
 
 
335 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 
310 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 
320 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
355 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 
366 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  28.53 
 
 
314 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 
324 aa  96.3  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  28.12 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 
325 aa  93.6  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
339 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 
327 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 
323 aa  89.4  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 
337 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 
354 aa  87.4  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
346 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 
323 aa  86.3  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  24.64 
 
 
317 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  24.93 
 
 
317 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  25.97 
 
 
322 aa  84  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  24.64 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  24.64 
 
 
317 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
328 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  24.64 
 
 
317 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  23.84 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  24.35 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>