187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4193 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  100 
 
 
394 aa  809    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  61.03 
 
 
359 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  62.02 
 
 
366 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  57.33 
 
 
362 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  59.69 
 
 
363 aa  444  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  54.06 
 
 
359 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  54.06 
 
 
359 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  54.99 
 
 
357 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  54.82 
 
 
359 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  53.03 
 
 
359 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  53.9 
 
 
358 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  53.98 
 
 
357 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  54.22 
 
 
356 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  52.56 
 
 
383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  52.56 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  52.56 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  52.31 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  52.56 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  52.56 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  51.16 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  49.87 
 
 
357 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  52.31 
 
 
359 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  52.56 
 
 
359 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  52.56 
 
 
359 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  52.56 
 
 
359 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  52.05 
 
 
384 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  53.08 
 
 
359 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  51.54 
 
 
358 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  50.96 
 
 
331 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  50.98 
 
 
326 aa  358  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  43.75 
 
 
342 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  43.31 
 
 
344 aa  292  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  43.43 
 
 
341 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  40.63 
 
 
352 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  38.11 
 
 
371 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  36.9 
 
 
343 aa  253  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 
363 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 
365 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  38.86 
 
 
349 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  35.36 
 
 
354 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  37.8 
 
 
357 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  35.84 
 
 
354 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  36.1 
 
 
354 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  37.18 
 
 
400 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  35.7 
 
 
354 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  37.08 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  34.13 
 
 
348 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  36.29 
 
 
374 aa  226  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  35.29 
 
 
352 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  32.98 
 
 
349 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.96 
 
 
344 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 
344 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  32.35 
 
 
354 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 
369 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  32.53 
 
 
329 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
340 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 
344 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 
321 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
321 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 
329 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  26.93 
 
 
331 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 
324 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 
324 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  26.95 
 
 
353 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  27.39 
 
 
331 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  28.53 
 
 
335 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 
324 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  25.08 
 
 
324 aa  99.8  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  23.88 
 
 
355 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  35.43 
 
 
327 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
350 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  23.65 
 
 
325 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  26.65 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  27.56 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  24.2 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  29.84 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 
320 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 
323 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  26.12 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 
862 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  30.51 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  22.96 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1691  beta-lactamase domain protein  46.38 
 
 
72 aa  73.6  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  32.02 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.33 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  23.38 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.11 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>