167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1853 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1853  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 356 aa  723    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.08 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25.75 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  30.06 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  23.59 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  23.88 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  33.96 
 
 		 637 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  23.86 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  24.1 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2362  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  22.64 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2969  metallo-beta-lactamase family protein  32.62 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2499  metallo-beta-lactamase family protein  31.88 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2433  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000453521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  26.51 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  22.84 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  22.22 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  25.38 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  26.23 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2169  Zn-dependent hydrolase  30 
 
 		 288 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0145337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2155  Zn-dependent hydrolase  30 
 
 		 288 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  28.95 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2414  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 288 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  28.1 
 
 		 644 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  23.62 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2235  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2399  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.295399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.3 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  23.77 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25.3 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2207  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25.3 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  23.62 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  22.87 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  27.31 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  25.8 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  21.94 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  22.82 
 
 		 591 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  23.62 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  21.53 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.53 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 275 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.31 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  32.17 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  23.47 
 
 		 333 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.89 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.52 
 
 		 310 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  40.82 
 
 		 318 aa  52.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  21.82 
 
 		 308 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  26.42 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  26.42 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  23.16 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  27.94 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  22.08 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  23.16 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  23.93 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  23.67 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  24.3 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  26.11 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  23.47 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  22.63 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1537  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299515  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  25.41 
 
 		 316 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  22.26 
 
 		 295 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  29.1 
 
 		 287 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  25.24 
 
 		 316 aa  50.4  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.47 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>