119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05310 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05310  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 
238 aa  494  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  41.42 
 
 
238 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4498  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 
194 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0460  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516875  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  25.24 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4497  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000128242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1310  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  26.19 
 
 
232 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  27.33 
 
 
307 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 
307 aa  55.5  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  27.81 
 
 
228 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
318 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  26.99 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  25.75 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  22.77 
 
 
318 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 
310 aa  52.8  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  25.32 
 
 
316 aa  52  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 
263 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 
318 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  40.35 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  40 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.09 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  26.09 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  31.34 
 
 
290 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  40 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 
345 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  23.39 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 
306 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  23.5 
 
 
336 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.36 
 
 
316 aa  48.5  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
319 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  23.35 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  23.35 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0062  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 
336 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  23.35 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  23 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  23.81 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 
325 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  23.63 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  25.22 
 
 
321 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1251  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 
196 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.809975  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4168  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 
318 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  38.33 
 
 
217 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51250  hypothetical protein  32.95 
 
 
252 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188489 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  19.4 
 
 
263 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  34.48 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 
275 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  25.22 
 
 
297 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  28.3 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  29.41 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 
241 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 
208 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  27.01 
 
 
321 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 
298 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 
306 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 
243 aa  45.1  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  22.83 
 
 
226 aa  45.1  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  25.97 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  24.87 
 
 
330 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  21.82 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1550  Beta-lactamase-like  32.95 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 
288 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1129  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000396645  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 
325 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22660  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.94 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.662338 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  23.18 
 
 
328 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  27.84 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  25.74 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  23.53 
 
 
500 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  27.54 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4385  hypothetical protein  36.76 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  23.94 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  22.33 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  25.43 
 
 
320 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3951  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.82 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00829584  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0068  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.84 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  24.04 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 
319 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  26.58 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0408  hypothetical protein  39.62 
 
 
254 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  23.81 
 
 
294 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
361 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  36.71 
 
 
556 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>