More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2292 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
321 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  53.44 
 
 
322 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  49.13 
 
 
322 aa  285  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  51.38 
 
 
285 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  51.3 
 
 
275 aa  269  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  50.2 
 
 
285 aa  269  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  50.2 
 
 
285 aa  268  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  50.2 
 
 
285 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  50.2 
 
 
281 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  49.41 
 
 
281 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  49.23 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  49.41 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  49.41 
 
 
285 aa  265  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  51.47 
 
 
295 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  52.02 
 
 
296 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  56.18 
 
 
300 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  52.87 
 
 
299 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  52.76 
 
 
294 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  50.59 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  51.33 
 
 
295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  50.76 
 
 
299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  50.76 
 
 
299 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  50.82 
 
 
277 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  49.03 
 
 
273 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6386  beta-lactamase domain-containing protein  39 
 
 
300 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 
244 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 
242 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 
226 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 
402 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 
231 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 
243 aa  79  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 
192 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  30.47 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  32.28 
 
 
210 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  27.35 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  28.18 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  30.43 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 
206 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  26.36 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  26.36 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  26.36 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  26.36 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  36.59 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  26.36 
 
 
217 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.18 
 
 
211 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  30.23 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  28.83 
 
 
209 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  25.91 
 
 
217 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 
244 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  29.91 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  28.83 
 
 
209 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
208 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 
240 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  27.97 
 
 
354 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.34 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
246 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.85 
 
 
329 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  27.61 
 
 
209 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  28.22 
 
 
209 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  27.61 
 
 
209 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 
211 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
223 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 
241 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  28.99 
 
 
240 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  28.99 
 
 
240 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  28.22 
 
 
209 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  27.24 
 
 
272 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  27.22 
 
 
217 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
232 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 
216 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  26.99 
 
 
209 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  30 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  27.22 
 
 
217 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  31.97 
 
 
209 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 
247 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  28.97 
 
 
240 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  31.79 
 
 
224 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  29.68 
 
 
246 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
207 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>