105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6386 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6386  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  600  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  50.37 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  45.29 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  50.39 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  45.42 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  43.06 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  43.2 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  42.8 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  41.06 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  41.18 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  34.26 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  34.26 
 
 		 281 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  34.15 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  34.88 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  34.15 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  35.54 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  39.37 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  34.74 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  34.88 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 		 322 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  39 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  34.16 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  33.7 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  33.72 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 		 210 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  32.61 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  32.61 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.52 
 
 		 209 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.52 
 
 		 209 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  30.39 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  37.88 
 
 		 208 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  37.88 
 
 		 208 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 209 aa  49.3  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  43.04 
 
 		 214 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  33.7 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  47.22 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22660  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.78 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.662338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  39.73 
 
 		 447 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  37.18 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  40.43 
 
 		 213 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  33.78 
 
 		 217 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  51.43 
 
 		 211 aa  46.2  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0850  Beta-lactamase-like  40.32 
 
 		 197 aa  45.8  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  33.78 
 
 		 217 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  27.06 
 
 		 207 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 198 aa  45.8  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  35.9 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  35.9 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 		 558 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 564 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  36.05 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  35.9 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 556 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.18 
 
 		 558 aa  43.9  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  43.9 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  33.33 
 
 		 217 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  34.88 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 560 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  27.83 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  30.68 
 
 		 555 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  44.44 
 
 		 207 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 		 246 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  38.96 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 240 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.07 
 
 		 213 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 240 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  33.64 
 
 		 225 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 205 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  47.37 
 
 		 208 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 240 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  28.57 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  51.22 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  40.32 
 
 		 210 aa  42.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 240 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 		 233 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 557 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 240 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  46.15 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  42.25 
 
 		 204 aa  42.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>