More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2427 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
300 aa  587  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  79.26 
 
 
299 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  77.59 
 
 
299 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  76.92 
 
 
299 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  71.72 
 
 
295 aa  417  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  71.72 
 
 
295 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  66.22 
 
 
296 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  60.55 
 
 
277 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  56.25 
 
 
294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  49.63 
 
 
285 aa  292  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  49.63 
 
 
281 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  48.54 
 
 
285 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  48.18 
 
 
285 aa  288  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  48.35 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  47.99 
 
 
285 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  48.35 
 
 
285 aa  285  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  49.26 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  48.15 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  55.92 
 
 
282 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  51.34 
 
 
322 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  49.82 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  56.18 
 
 
321 aa  272  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  48.66 
 
 
275 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  49.81 
 
 
273 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6386  beta-lactamase domain-containing protein  50.39 
 
 
300 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 
402 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  31.07 
 
 
217 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  31.73 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  31.73 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  31.73 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  31.73 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  37.97 
 
 
228 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  31.73 
 
 
217 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  30.1 
 
 
217 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  30.39 
 
 
217 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  30.92 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  30.45 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  34.89 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  31.38 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  30.25 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  32.39 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
210 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  29.66 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  28.35 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  29.83 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  29.83 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  28.94 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  29.79 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  31.28 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  29.88 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  32.08 
 
 
232 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  27.98 
 
 
255 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 
243 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
209 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  30.77 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  30.53 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  28.25 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  28.25 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  30 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  27.68 
 
 
317 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  35.95 
 
 
232 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  33.77 
 
 
224 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  27.68 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 
211 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  26.61 
 
 
209 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.5 
 
 
209 aa  59.7  0.00000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  29.76 
 
 
237 aa  59.7  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
317 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  31.74 
 
 
323 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 
207 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 
207 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.54 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  29.53 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 
209 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 
247 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 
207 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 
210 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>