More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3996 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  596  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  65.54 
 
 		 299 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  64.86 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  64.86 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  66.22 
 
 		 300 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  63.95 
 
 		 295 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  63.27 
 
 		 295 aa  349  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  59.64 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  60 
 
 		 277 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  52.59 
 
 		 282 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  49.24 
 
 		 285 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  54.03 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  48.48 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  49.03 
 
 		 285 aa  280  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  49.03 
 
 		 281 aa  280  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  48.09 
 
 		 285 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  48.66 
 
 		 285 aa  278  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  48.66 
 
 		 285 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  48.65 
 
 		 285 aa  278  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  48.45 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  48.65 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  52.02 
 
 		 321 aa  264  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  45.49 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6386  beta-lactamase domain-containing protein  50.37 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  45.49 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  29.58 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  28.83 
 
 		 217 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  30.59 
 
 		 217 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  29.28 
 
 		 217 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  28.69 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  28.28 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  28.28 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  28.28 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  28.28 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  30.68 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  31.2 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  38.52 
 
 		 240 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  31.75 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 226 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  28.69 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  28.69 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  28.33 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  28.69 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  28.69 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  27.87 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.87 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  33.88 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  28.1 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.28 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  28.08 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  28.08 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  28.24 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  27.4 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  24.49 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  26.17 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  34.93 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  26.17 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  29.22 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  26.45 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>