More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0508 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 295 aa  577  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  84.98 
 
 		 295 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  75.08 
 
 		 299 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  74.07 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  73.74 
 
 		 299 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  71.72 
 
 		 300 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  63.95 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  58.46 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  54.24 
 
 		 294 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  50.58 
 
 		 285 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  50.58 
 
 		 281 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  49.81 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  50.19 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  50.19 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  50.19 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  49.81 
 
 		 285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  49.81 
 
 		 281 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  49.81 
 
 		 285 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  49.42 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  52.71 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  47.69 
 
 		 275 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  50.4 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  51.33 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  46.59 
 
 		 273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6386  beta-lactamase domain-containing protein  43.06 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  27.14 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  29.67 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  28.64 
 
 		 217 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.39 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  26.67 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  32.89 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  28.17 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  28.17 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  28.17 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  28.17 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  25.47 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  25.47 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  25.47 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  28.3 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  31.75 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.81 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  26.07 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.67 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  29.6 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  25.94 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  27.6 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  27.6 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  25 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  28.38 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  25.47 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  28.25 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  36.51 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  31.09 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  28.38 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  26.84 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  28.38 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  28.38 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  24.88 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  33.74 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  27.72 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>