More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2424 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 322 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  51.84 
 
 		 322 aa  288  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  49.64 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  48.48 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  49.82 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  50.19 
 
 		 295 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  51.55 
 
 		 285 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  51.16 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  51.94 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  51.94 
 
 		 285 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  51.94 
 
 		 281 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  51.95 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  47.99 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  51.15 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  50.77 
 
 		 281 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  51.74 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  50.39 
 
 		 285 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  50 
 
 		 285 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  47.62 
 
 		 299 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  46.37 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  46.4 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  50.98 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  46.51 
 
 		 275 aa  242  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  46.3 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6386  beta-lactamase domain-containing protein  39.37 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 		 240 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  31.38 
 
 		 240 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 240 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  30.13 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  30.13 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 240 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  30.48 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  29.71 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  29.71 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  31.25 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  29.05 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  28.51 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  28.51 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  28.51 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  28.51 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  28.51 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  28.97 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  31.56 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  28.26 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  30.26 
 
 		 239 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 221 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  38.33 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  27.75 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  36.13 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  25.49 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  27.51 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  24.27 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  27.03 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.48 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  29.94 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  27.03 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  27.19 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  32.43 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  25.82 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  32.43 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  32.43 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  32.43 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  25.68 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 210 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>