More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4141 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  59.43 
 
 		 556 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  74.37 
 
 		 557 aa  874    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  91.34 
 
 		 557 aa  1040    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  57.91 
 
 		 556 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  57.37 
 
 		 557 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  73.47 
 
 		 557 aa  866    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  57.19 
 
 		 556 aa  641    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 556 aa  1120    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  73.29 
 
 		 557 aa  864    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  57.01 
 
 		 556 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  57.91 
 
 		 557 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  74.15 
 
 		 557 aa  837    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  56.83 
 
 		 556 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  57.07 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  56.47 
 
 		 556 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  55.68 
 
 		 556 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  51.62 
 
 		 555 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  52.33 
 
 		 558 aa  585  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  52.33 
 
 		 558 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  51.79 
 
 		 558 aa  579  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  51.08 
 
 		 555 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  54.73 
 
 		 555 aa  569  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  51.17 
 
 		 556 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  51.63 
 
 		 567 aa  558  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  51.53 
 
 		 556 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.09 
 
 		 558 aa  546  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  45.32 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  45.32 
 
 		 564 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  46.75 
 
 		 546 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  45.05 
 
 		 560 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  45.5 
 
 		 550 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  43.37 
 
 		 548 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  39.89 
 
 		 540 aa  439  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  44.12 
 
 		 544 aa  435  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  44.28 
 
 		 548 aa  433  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  38.14 
 
 		 544 aa  422  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  42.5 
 
 		 557 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  40.18 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  40.26 
 
 		 558 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  41.93 
 
 		 542 aa  411  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  38.16 
 
 		 544 aa  405  1.0000000000000001e-112  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  40.69 
 
 		 558 aa  405  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  40.33 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  41.77 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  41.77 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  39.32 
 
 		 558 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  38.92 
 
 		 558 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  38.96 
 
 		 558 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  38.43 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  39.14 
 
 		 593 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  47.03 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 		 560 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  39.85 
 
 		 533 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  38.19 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 		 566 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  42.38 
 
 		 447 aa  347  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  37.48 
 
 		 554 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  38.78 
 
 		 554 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  41.77 
 
 		 572 aa  344  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  36.25 
 
 		 555 aa  344  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  35.23 
 
 		 555 aa  343  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 561 aa  343  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  39.57 
 
 		 559 aa  342  9e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  37.66 
 
 		 569 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  35.73 
 
 		 555 aa  340  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  38.77 
 
 		 547 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  35.65 
 
 		 553 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 		 559 aa  337  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 		 561 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  36.91 
 
 		 554 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.62 
 
 		 555 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  35.62 
 
 		 555 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  44.29 
 
 		 560 aa  333  5e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  40.32 
 
 		 550 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  40.32 
 
 		 546 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.28 
 
 		 561 aa  330  6e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  40.5 
 
 		 546 aa  330  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  40.11 
 
 		 580 aa  329  9e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 		 618 aa  329  9e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  38.9 
 
 		 650 aa  328  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  35.64 
 
 		 644 aa  328  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  36.8 
 
 		 556 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  39.88 
 
 		 550 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 		 560 aa  325  2e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 		 595 aa  325  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  34.59 
 
 		 555 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  36.9 
 
 		 631 aa  324  2e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  36.56 
 
 		 551 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  38.25 
 
 		 561 aa  323  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  40.43 
 
 		 561 aa  323  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  39.71 
 
 		 551 aa  323  7e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  39.71 
 
 		 551 aa  322  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  39.51 
 
 		 551 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  38.59 
 
 		 558 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  38.59 
 
 		 558 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  38.59 
 
 		 558 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  38.06 
 
 		 556 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  38.06 
 
 		 556 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>