More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2074 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
560 aa  1125    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  46.95 
 
 
548 aa  359  9e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  42.44 
 
 
548 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  43.99 
 
 
544 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  43.44 
 
 
461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 
546 aa  336  7e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  45.22 
 
 
558 aa  335  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  45.22 
 
 
558 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  43.1 
 
 
447 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  44.39 
 
 
567 aa  335  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  45 
 
 
558 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  43.6 
 
 
564 aa  333  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  44.29 
 
 
556 aa  333  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  43.16 
 
 
557 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  42.45 
 
 
556 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  43.4 
 
 
557 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  42.92 
 
 
557 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  43.16 
 
 
556 aa  329  9e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.92 
 
 
557 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  45.39 
 
 
556 aa  326  7e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  43.81 
 
 
557 aa  325  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  42.22 
 
 
556 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  42.52 
 
 
555 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  42.45 
 
 
556 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  43.1 
 
 
560 aa  323  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  40.33 
 
 
440 aa  322  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  43.33 
 
 
555 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  42.45 
 
 
556 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  43.4 
 
 
556 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  41.15 
 
 
550 aa  319  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  43.4 
 
 
557 aa  319  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  41.84 
 
 
556 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 
556 aa  316  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  43.66 
 
 
555 aa  316  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  41.75 
 
 
556 aa  315  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  43.33 
 
 
557 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  43.16 
 
 
556 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  36.79 
 
 
544 aa  303  6.000000000000001e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.02 
 
 
558 aa  300  4e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  38.16 
 
 
544 aa  299  8e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  37.08 
 
 
553 aa  296  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  36.99 
 
 
542 aa  295  1e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  39.01 
 
 
560 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  37.44 
 
 
540 aa  295  2e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  38.66 
 
 
558 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 
556 aa  289  9e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  36.58 
 
 
554 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0096  beta-lactamase domain-containing protein  43.4 
 
 
550 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.458831 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  38.72 
 
 
557 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  38.68 
 
 
561 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  39.72 
 
 
558 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  38.12 
 
 
555 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 
556 aa  286  8e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  37.47 
 
 
590 aa  286  8e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  38.85 
 
 
558 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  38.02 
 
 
644 aa  285  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 
551 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 
558 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  37.26 
 
 
551 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  37.5 
 
 
551 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  38.35 
 
 
631 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  36.58 
 
 
566 aa  282  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  34.29 
 
 
555 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  34.49 
 
 
555 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  38.72 
 
 
557 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  38.72 
 
 
557 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2016  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.93 
 
 
578 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0968063  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  36.15 
 
 
554 aa  281  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  37.59 
 
 
559 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
558 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  37.88 
 
 
593 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 
553 aa  279  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  37.73 
 
 
554 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  40.62 
 
 
563 aa  277  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  38.44 
 
 
569 aa  277  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  38.62 
 
 
561 aa  277  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  37.59 
 
 
551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  35.76 
 
 
555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  37.35 
 
 
555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
561 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 
561 aa  274  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  38.46 
 
 
556 aa  273  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  34.67 
 
 
677 aa  273  7e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  35.51 
 
 
555 aa  273  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  36.26 
 
 
554 aa  273  9e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  36.17 
 
 
554 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 
554 aa  271  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  41.84 
 
 
550 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 
618 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
560 aa  270  7e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.4 
 
 
564 aa  270  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  37.03 
 
 
559 aa  270  7e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  35.46 
 
 
558 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  39.51 
 
 
580 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  39.6 
 
 
561 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  38.28 
 
 
547 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  39.86 
 
 
546 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  35.88 
 
 
548 aa  266  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  34.52 
 
 
645 aa  266  5e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  37.97 
 
 
533 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>