299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2228 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  68.77 
 
 		 557 aa  768    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  63.26 
 
 		 556 aa  726    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  68.77 
 
 		 557 aa  768    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  60.72 
 
 		 558 aa  700    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  61.55 
 
 		 555 aa  729    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  68.05 
 
 		 557 aa  773    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 558 aa  1124    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  41.41 
 
 		 557 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  41.41 
 
 		 557 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  41.05 
 
 		 557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  40.69 
 
 		 556 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  41.08 
 
 		 567 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  40.07 
 
 		 557 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  41.17 
 
 		 556 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  41.37 
 
 		 557 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.48 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  40.52 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  39.43 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  40.07 
 
 		 555 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  39.45 
 
 		 556 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  40.44 
 
 		 556 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  40.92 
 
 		 556 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  40.92 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  40.07 
 
 		 556 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 		 556 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 564 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  37.79 
 
 		 560 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  39.14 
 
 		 546 aa  365  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  39.35 
 
 		 544 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  36.53 
 
 		 558 aa  362  9e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  36.53 
 
 		 558 aa  362  9e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  36.71 
 
 		 558 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 548 aa  360  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  38.41 
 
 		 556 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  38.2 
 
 		 550 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  38.85 
 
 		 556 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  37.66 
 
 		 555 aa  357  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  38.3 
 
 		 556 aa  349  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.59 
 
 		 558 aa  346  5e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  38.09 
 
 		 555 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  34.65 
 
 		 544 aa  331  2e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  33.82 
 
 		 540 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  32.55 
 
 		 544 aa  327  2.0000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 		 560 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  36.58 
 
 		 548 aa  324  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  34.95 
 
 		 542 aa  319  9e-86  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  32.8 
 
 		 555 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  34.56 
 
 		 555 aa  303  8.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  42.18 
 
 		 461 aa  295  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 		 554 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  39.72 
 
 		 560 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  31.83 
 
 		 555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  31.83 
 
 		 555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  36.34 
 
 		 558 aa  286  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 		 554 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  31.32 
 
 		 553 aa  286  8e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 555 aa  286  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  31.45 
 
 		 677 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  35.86 
 
 		 580 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 559 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 558 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 		 593 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  33.87 
 
 		 553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  33.09 
 
 		 644 aa  283  5.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  35.55 
 
 		 554 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  33.9 
 
 		 618 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  33.69 
 
 		 558 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 		 558 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  35.77 
 
 		 559 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 		 554 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  36.62 
 
 		 550 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  34.11 
 
 		 565 aa  276  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  36.88 
 
 		 546 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 552 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  36.88 
 
 		 546 aa  276  9e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  36.38 
 
 		 447 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  30.55 
 
 		 645 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  34.66 
 
 		 551 aa  274  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  34.45 
 
 		 551 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 		 548 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 572 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  35.65 
 
 		 555 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  34.24 
 
 		 551 aa  272  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 591 aa  272  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  35.67 
 
 		 555 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  32.8 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  33.96 
 
 		 561 aa  271  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 556 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  31.35 
 
 		 560 aa  270  5e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  36.35 
 
 		 561 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  35.03 
 
 		 555 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.06 
 
 		 559 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  35.03 
 
 		 555 aa  270  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  35.03 
 
 		 555 aa  270  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  35.03 
 
 		 555 aa  270  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.09 
 
 		 561 aa  270  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  35.03 
 
 		 555 aa  270  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.03 
 
 		 555 aa  270  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.03 
 
 		 555 aa  270  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>