More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0324 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  61.15 
 
 
560 aa  713    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  61.58 
 
 
565 aa  724    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  63.27 
 
 
555 aa  752    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  77.38 
 
 
559 aa  888    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  63.27 
 
 
555 aa  751    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  63.27 
 
 
555 aa  751    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  63.27 
 
 
555 aa  751    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  63.27 
 
 
555 aa  751    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  62.45 
 
 
555 aa  731    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  62.39 
 
 
555 aa  736    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  63.27 
 
 
555 aa  751    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  63.27 
 
 
555 aa  753    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  62.91 
 
 
555 aa  753    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1516  beta-lactamase domain-containing protein  59.96 
 
 
618 aa  684    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  62.91 
 
 
555 aa  748    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  61.58 
 
 
565 aa  724    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  100 
 
 
561 aa  1145    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  60.72 
 
 
573 aa  692    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  63.27 
 
 
555 aa  751    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  58.27 
 
 
559 aa  689    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  59.68 
 
 
560 aa  714    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  76.92 
 
 
560 aa  901    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  62.91 
 
 
555 aa  750    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.08 
 
 
555 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 
556 aa  566  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  49.82 
 
 
556 aa  567  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  49.82 
 
 
556 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  49.82 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  49.82 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  49.82 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  49.82 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  49.82 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  49.82 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  49.82 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  49.64 
 
 
583 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  47.21 
 
 
557 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  47.39 
 
 
557 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  47.03 
 
 
557 aa  548  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.66 
 
 
557 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  46.44 
 
 
555 aa  551  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  46.44 
 
 
555 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.73 
 
 
557 aa  548  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  47.57 
 
 
557 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.3 
 
 
557 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.45 
 
 
557 aa  548  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  46.13 
 
 
557 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  47.27 
 
 
555 aa  532  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  46.57 
 
 
559 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  46.8 
 
 
554 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  44.24 
 
 
560 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  46.4 
 
 
555 aa  524  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  45.52 
 
 
618 aa  520  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  46.96 
 
 
558 aa  518  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  46 
 
 
554 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  44.06 
 
 
555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  44.61 
 
 
555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  44.42 
 
 
551 aa  512  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  44.17 
 
 
554 aa  511  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  45.16 
 
 
553 aa  508  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  44.82 
 
 
554 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  44.79 
 
 
566 aa  507  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  45.03 
 
 
556 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  43.92 
 
 
555 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  43.41 
 
 
560 aa  504  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0623  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.69 
 
 
611 aa  499  1e-140  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0867442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  43.19 
 
 
553 aa  500  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl570  putative metallo-beta lactamase hydrolase  43.96 
 
 
588 aa  494  9.999999999999999e-139  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00258207  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  43.8 
 
 
551 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  43.61 
 
 
551 aa  491  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  43.25 
 
 
551 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  45.78 
 
 
591 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  42.5 
 
 
561 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  42.26 
 
 
553 aa  472  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  42.13 
 
 
561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  42.99 
 
 
552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  42.28 
 
 
558 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 
557 aa  462  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  41.94 
 
 
558 aa  465  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  42.5 
 
 
533 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  41.71 
 
 
569 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  40.69 
 
 
556 aa  458  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1361  beta-lactamase domain-containing protein  39.67 
 
 
574 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1335  beta-lactamase domain-containing protein  39.67 
 
 
574 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.547881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 
558 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  40.07 
 
 
547 aa  458  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  40.62 
 
 
593 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  41.61 
 
 
548 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  40.77 
 
 
558 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  43.19 
 
 
561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0842  metallo-beta-lactamase family protein  39.49 
 
 
568 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  41.49 
 
 
564 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  43.77 
 
 
588 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  43.77 
 
 
588 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18611  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.96 
 
 
662 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0649  beta-lactamase domain-containing protein  39.93 
 
 
593 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000403625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1744  hypothetical protein  42.78 
 
 
660 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0589  hypothetical protein  41.7 
 
 
596 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113307  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18421  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.6 
 
 
661 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3608  hypothetical protein  41.96 
 
 
589 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  41.28 
 
 
554 aa  433  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>