294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3211 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  57.5 
 
 		 564 aa  638    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  58.66 
 
 		 556 aa  658    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 567 aa  1138    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  52.17 
 
 		 555 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  52.72 
 
 		 556 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  53.89 
 
 		 560 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  54.17 
 
 		 556 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  50.91 
 
 		 556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  52.72 
 
 		 556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  52.27 
 
 		 555 aa  569  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  50.91 
 
 		 558 aa  561  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  52.9 
 
 		 556 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  50.91 
 
 		 558 aa  561  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  51.45 
 
 		 557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  52.17 
 
 		 556 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  51.09 
 
 		 558 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  52.17 
 
 		 557 aa  559  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  50.91 
 
 		 557 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  51.63 
 
 		 556 aa  558  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  50.81 
 
 		 557 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  50.45 
 
 		 557 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  50.45 
 
 		 557 aa  554  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  50.09 
 
 		 556 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  50.45 
 
 		 548 aa  546  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  50.27 
 
 		 556 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  50.45 
 
 		 556 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  51.37 
 
 		 555 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  50.63 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.82 
 
 		 558 aa  525  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  48.82 
 
 		 556 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  49.82 
 
 		 544 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  48.9 
 
 		 550 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  49.19 
 
 		 546 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  41.31 
 
 		 544 aa  456  1e-127  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  45.57 
 
 		 548 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  43.71 
 
 		 540 aa  456  1e-127  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  42.78 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  42.08 
 
 		 544 aa  435  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  41.53 
 
 		 542 aa  422  1e-117  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  43.53 
 
 		 557 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  49.32 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  42.75 
 
 		 558 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  43.53 
 
 		 557 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  43.53 
 
 		 557 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  41.08 
 
 		 558 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  41.85 
 
 		 556 aa  401  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  43.95 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  43.24 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  39.34 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  40.89 
 
 		 533 aa  359  8e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  39.04 
 
 		 593 aa  352  7e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 		 558 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  38.82 
 
 		 558 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  35.35 
 
 		 555 aa  350  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  37.29 
 
 		 558 aa  348  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 		 554 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  41.03 
 
 		 559 aa  343  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  38.9 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.16 
 
 		 561 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  44.39 
 
 		 560 aa  335  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  38.9 
 
 		 561 aa  335  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 		 561 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 		 569 aa  333  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  37.87 
 
 		 563 aa  332  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  37.08 
 
 		 554 aa  330  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 		 554 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  36.47 
 
 		 556 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  37.04 
 
 		 555 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  39.1 
 
 		 555 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  35.85 
 
 		 555 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  37.27 
 
 		 558 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  37.78 
 
 		 561 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.89 
 
 		 555 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  37.23 
 
 		 555 aa  327  5e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.48 
 
 		 561 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  39.74 
 
 		 595 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 561 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  34.06 
 
 		 554 aa  324  2e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  34.81 
 
 		 549 aa  323  6e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  35.75 
 
 		 547 aa  323  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 618 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  39.59 
 
 		 561 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  36.19 
 
 		 631 aa  319  7.999999999999999e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  36.73 
 
 		 551 aa  319  9e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  33.52 
 
 		 560 aa  319  9e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  38.45 
 
 		 565 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  37.2 
 
 		 561 aa  318  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 		 551 aa  318  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 		 554 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3608  hypothetical protein  37.02 
 
 		 589 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  37.92 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  37.07 
 
 		 588 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  37.07 
 
 		 588 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  37.18 
 
 		 553 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  36.72 
 
 		 568 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  38.95 
 
 		 650 aa  317  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 		 551 aa  316  6e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  35.61 
 
 		 553 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  40.08 
 
 		 561 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  37.99 
 
 		 561 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>