More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0763 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  66.85 
 
 		 557 aa  764    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  66.85 
 
 		 557 aa  764    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  62.73 
 
 		 558 aa  722    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  67.21 
 
 		 556 aa  793    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  100 
 
 		 555 aa  1129    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  67.03 
 
 		 557 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  61.55 
 
 		 558 aa  729    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  42.78 
 
 		 567 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  39.82 
 
 		 557 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  39.82 
 
 		 557 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  40.18 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  40.97 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  40.33 
 
 		 556 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  39.64 
 
 		 557 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  39.75 
 
 		 558 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  41.09 
 
 		 557 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  39.75 
 
 		 558 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  39.57 
 
 		 558 aa  405  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  41.45 
 
 		 555 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.34 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  39.17 
 
 		 555 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  39.09 
 
 		 556 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  40.22 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  38.78 
 
 		 546 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  38.8 
 
 		 556 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  38.22 
 
 		 548 aa  382  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 		 544 aa  377  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  39.31 
 
 		 556 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  39.34 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  37.52 
 
 		 556 aa  379  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  38.15 
 
 		 564 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  37.09 
 
 		 560 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  37.16 
 
 		 544 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 		 556 aa  369  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  38.25 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 556 aa  365  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.74 
 
 		 558 aa  362  1e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 		 556 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  37.94 
 
 		 550 aa  358  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  36.18 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  33.45 
 
 		 544 aa  353  5e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  37.32 
 
 		 542 aa  351  2e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 		 548 aa  336  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  37.45 
 
 		 560 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.64 
 
 		 555 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  35.64 
 
 		 555 aa  333  7.000000000000001e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  36.69 
 
 		 555 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  35.08 
 
 		 558 aa  331  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 558 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 		 593 aa  326  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 618 aa  324  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  32.62 
 
 		 558 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  32.44 
 
 		 558 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 555 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 		 554 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  40.55 
 
 		 461 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  34.62 
 
 		 555 aa  309  6.999999999999999e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  35.38 
 
 		 551 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  35.18 
 
 		 551 aa  307  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 		 566 aa  307  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  35.18 
 
 		 551 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  35.7 
 
 		 565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  35.7 
 
 		 565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  35.04 
 
 		 551 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  36.32 
 
 		 561 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 573 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  34.79 
 
 		 559 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  32.25 
 
 		 555 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  34.77 
 
 		 554 aa  302  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  35.76 
 
 		 590 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 		 554 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  32.91 
 
 		 533 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  34.4 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  33.39 
 
 		 645 aa  300  3e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  34.89 
 
 		 559 aa  300  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  33.15 
 
 		 562 aa  300  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  34.86 
 
 		 560 aa  298  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  35.36 
 
 		 631 aa  299  1e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 580 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 		 561 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 562 aa  298  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0950  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 		 619 aa  298  2e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 548 aa  297  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  32.8 
 
 		 662 aa  296  4e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  32.8 
 
 		 662 aa  296  5e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  32.66 
 
 		 565 aa  296  7e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 553 aa  296  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  30.59 
 
 		 553 aa  296  7e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  32.8 
 
 		 662 aa  296  8e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 		 550 aa  294  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  31.9 
 
 		 652 aa  294  4e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 		 556 aa  293  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  34.22 
 
 		 550 aa  293  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 		 557 aa  292  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  33.15 
 
 		 564 aa  292  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  31.72 
 
 		 677 aa  292  9e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>