More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2305 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 461 aa  926    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  48.65 
 
 		 447 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  49.32 
 
 		 567 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  47.18 
 
 		 556 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  47.61 
 
 		 560 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  48.11 
 
 		 548 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  46.26 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  45.74 
 
 		 558 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  45.75 
 
 		 564 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  45.05 
 
 		 558 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  46.77 
 
 		 548 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  45.74 
 
 		 558 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  39.43 
 
 		 544 aa  382  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  46.85 
 
 		 557 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  47.26 
 
 		 550 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  40.09 
 
 		 540 aa  382  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  46.24 
 
 		 544 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  45.27 
 
 		 555 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  47.97 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  46.58 
 
 		 556 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  47.03 
 
 		 556 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  45.17 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  44.04 
 
 		 556 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  44.72 
 
 		 556 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  42.79 
 
 		 542 aa  370  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  45.89 
 
 		 556 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  45.43 
 
 		 546 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  43.92 
 
 		 555 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  45.89 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  45.66 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  38.86 
 
 		 544 aa  363  4e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  45.5 
 
 		 556 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.03 
 
 		 558 aa  360  2e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  43.54 
 
 		 557 aa  360  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  46.58 
 
 		 556 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  43.11 
 
 		 557 aa  359  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  43.11 
 
 		 557 aa  358  8e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  45.76 
 
 		 557 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  45.3 
 
 		 556 aa  355  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  44.97 
 
 		 556 aa  352  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  43.12 
 
 		 556 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  43.44 
 
 		 560 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.8 
 
 		 555 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  40.55 
 
 		 555 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  38.8 
 
 		 555 aa  317  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  38.02 
 
 		 561 aa  312  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 		 590 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  38.18 
 
 		 560 aa  309  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  40.18 
 
 		 559 aa  308  9e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  40.95 
 
 		 557 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  41 
 
 		 556 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  42.18 
 
 		 558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  42.02 
 
 		 556 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  37.72 
 
 		 631 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  41.63 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  41.63 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  37.47 
 
 		 555 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  37.8 
 
 		 553 aa  293  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  35.28 
 
 		 554 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 		 558 aa  292  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  38.02 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  36.4 
 
 		 644 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  37.33 
 
 		 558 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  41.05 
 
 		 563 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 551 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  37.9 
 
 		 558 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  35.81 
 
 		 555 aa  289  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  35.97 
 
 		 548 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  36.21 
 
 		 566 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 		 555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  37.84 
 
 		 554 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 		 593 aa  286  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  36.95 
 
 		 559 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  37.53 
 
 		 569 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0589  hypothetical protein  35.7 
 
 		 596 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  38.41 
 
 		 558 aa  283  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  34.18 
 
 		 645 aa  282  8.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 		 558 aa  282  9e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 549 aa  282  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  32.64 
 
 		 573 aa  281  1e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 572 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  37.17 
 
 		 552 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 		 558 aa  280  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1887  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.18 
 
 		 717 aa  280  5e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.441469  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  36.97 
 
 		 547 aa  280  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  38.1 
 
 		 564 aa  279  9e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  32.96 
 
 		 555 aa  276  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  35.27 
 
 		 560 aa  276  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 		 554 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  35.03 
 
 		 618 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  31.02 
 
 		 677 aa  274  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  40 
 
 		 550 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  36.83 
 
 		 554 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  40.22 
 
 		 546 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  34.78 
 
 		 556 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  36.22 
 
 		 559 aa  272  7e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  39.32 
 
 		 565 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0063  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 		 664 aa  271  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 		 560 aa  272  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>