More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1268 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  59.42 
 
 		 555 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  57.56 
 
 		 566 aa  679    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  57.79 
 
 		 558 aa  681    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  62.93 
 
 		 554 aa  749    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  54.69 
 
 		 558 aa  647    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  54.83 
 
 		 618 aa  641    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  53.28 
 
 		 558 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  66.97 
 
 		 554 aa  786    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  54.33 
 
 		 558 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  64.86 
 
 		 555 aa  776    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  63.83 
 
 		 554 aa  763    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  56.83 
 
 		 551 aa  655    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  64.66 
 
 		 553 aa  755    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  68.77 
 
 		 554 aa  800    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  55.66 
 
 		 558 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  62.09 
 
 		 559 aa  741    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  58.88 
 
 		 555 aa  701    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  59.24 
 
 		 555 aa  701    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 553 aa  1106    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  60.29 
 
 		 560 aa  729    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  58.23 
 
 		 555 aa  686    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  56.62 
 
 		 555 aa  688    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  54.53 
 
 		 556 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  54.35 
 
 		 556 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  54.17 
 
 		 556 aa  627  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  53.99 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  53.99 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  53.99 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  53.99 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  53.99 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  53.99 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  53.99 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  54.03 
 
 		 533 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  50.81 
 
 		 557 aa  617  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  50.63 
 
 		 557 aa  616  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  49.73 
 
 		 560 aa  617  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  53.44 
 
 		 583 aa  617  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.99 
 
 		 557 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.81 
 
 		 557 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.63 
 
 		 557 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  50.63 
 
 		 557 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.81 
 
 		 557 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  50.09 
 
 		 557 aa  609  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  51.64 
 
 		 548 aa  608  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  50.45 
 
 		 557 aa  609  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  50.09 
 
 		 593 aa  598  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  52.19 
 
 		 569 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  51 
 
 		 551 aa  592  1e-168  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  51.36 
 
 		 551 aa  592  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  49.82 
 
 		 555 aa  592  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  51 
 
 		 551 aa  591  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  50.18 
 
 		 555 aa  591  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  49.82 
 
 		 555 aa  588  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  50.18 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  50.18 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  50.18 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  49.28 
 
 		 555 aa  589  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  50.18 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  50.18 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  50.18 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  49.28 
 
 		 555 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  49.73 
 
 		 555 aa  585  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  49.73 
 
 		 547 aa  585  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  50.09 
 
 		 555 aa  585  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  51.55 
 
 		 555 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  51.09 
 
 		 556 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  49.28 
 
 		 591 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  49.91 
 
 		 561 aa  569  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  49.18 
 
 		 553 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  48.28 
 
 		 556 aa  561  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  49.37 
 
 		 557 aa  558  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  49.1 
 
 		 552 aa  558  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  49.28 
 
 		 555 aa  558  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  48.04 
 
 		 561 aa  552  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  47.2 
 
 		 560 aa  550  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  47.46 
 
 		 556 aa  551  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  47.51 
 
 		 561 aa  548  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  46.65 
 
 		 565 aa  545  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  46.65 
 
 		 565 aa  545  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  45.33 
 
 		 569 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  46.53 
 
 		 564 aa  529  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  46.22 
 
 		 572 aa  525  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1361  beta-lactamase domain-containing protein  44.89 
 
 		 574 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1335  beta-lactamase domain-containing protein  44.89 
 
 		 574 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.547881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  44.18 
 
 		 556 aa  512  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  46.34 
 
 		 560 aa  514  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  45.16 
 
 		 561 aa  508  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  46.13 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  46.17 
 
 		 561 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  44.46 
 
 		 561 aa  505  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  44.67 
 
 		 573 aa  507  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  44.2 
 
 		 560 aa  506  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  46.46 
 
 		 561 aa  505  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.52 
 
 		 559 aa  502  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.36 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  44.16 
 
 		 549 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  43.07 
 
 		 561 aa  495  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  43.45 
 
 		 561 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  43.8 
 
 		 561 aa  496  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  44.06 
 
 		 554 aa  496  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>