More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0787 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  57.91 
 
 		 644 aa  680    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  57.27 
 
 		 631 aa  669    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  58.53 
 
 		 590 aa  681    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 554 aa  1132    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  47.04 
 
 		 555 aa  525  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  47.41 
 
 		 554 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  46.5 
 
 		 555 aa  514  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  46.14 
 
 		 554 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  45.16 
 
 		 551 aa  507  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  46.07 
 
 		 554 aa  502  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  46.31 
 
 		 560 aa  505  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  46.79 
 
 		 559 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  43.68 
 
 		 591 aa  499  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  46.03 
 
 		 566 aa  495  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  44.19 
 
 		 555 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  44.06 
 
 		 553 aa  496  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  44.24 
 
 		 556 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  44.24 
 
 		 556 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  43.11 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  44.24 
 
 		 583 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  44.42 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  44.01 
 
 		 555 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  44.46 
 
 		 558 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  44.24 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  44.24 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  44.24 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.48 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  44.24 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  45.42 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  44.09 
 
 		 593 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  44.24 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  44.24 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  47.42 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 		 551 aa  485  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  43.12 
 
 		 557 aa  485  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  47.59 
 
 		 551 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  42.88 
 
 		 557 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  42.88 
 
 		 557 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  43.06 
 
 		 557 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.88 
 
 		 557 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.7 
 
 		 561 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  44.03 
 
 		 547 aa  487  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.93 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  43.45 
 
 		 561 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  43.4 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  42.96 
 
 		 555 aa  485  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.93 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1502  beta-lactamase domain-containing protein  43.32 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000603701  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  42.06 
 
 		 555 aa  478  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  42.7 
 
 		 560 aa  477  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  42.06 
 
 		 555 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.06 
 
 		 555 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.06 
 
 		 555 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  44.08 
 
 		 561 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.88 
 
 		 555 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  42.06 
 
 		 555 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  42.06 
 
 		 555 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.88 
 
 		 555 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  41.88 
 
 		 555 aa  475  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  42.06 
 
 		 555 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.43 
 
 		 561 aa  477  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  43.86 
 
 		 558 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.21 
 
 		 555 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  41.94 
 
 		 595 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  42.36 
 
 		 561 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 		 618 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  42.4 
 
 		 558 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  41.28 
 
 		 557 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  42.31 
 
 		 555 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  42.81 
 
 		 562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  42.81 
 
 		 562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  41.59 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  44.17 
 
 		 555 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  43.19 
 
 		 553 aa  467  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  44.65 
 
 		 552 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  42.65 
 
 		 555 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  42.81 
 
 		 568 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  41.95 
 
 		 555 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  40.65 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  42.08 
 
 		 561 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  42.94 
 
 		 533 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  42.52 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  41.24 
 
 		 561 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  42.73 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  42.26 
 
 		 560 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  41.55 
 
 		 565 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  41.27 
 
 		 566 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  42.6 
 
 		 558 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  41.13 
 
 		 650 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  43.42 
 
 		 561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  42.63 
 
 		 569 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 565 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  42.81 
 
 		 557 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  41.06 
 
 		 561 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 565 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  42.42 
 
 		 558 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  41.23 
 
 		 559 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 563 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  40.91 
 
 		 564 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>