282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2933 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  72.84 
 
 		 556 aa  832    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  57.27 
 
 		 557 aa  670    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  55.48 
 
 		 557 aa  645    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 556 aa  1105    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  55.68 
 
 		 556 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  56.01 
 
 		 557 aa  661    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  57.61 
 
 		 556 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  55.83 
 
 		 557 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  58.33 
 
 		 556 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  56.19 
 
 		 557 aa  629  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  57.07 
 
 		 556 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  55.83 
 
 		 557 aa  624  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  56.16 
 
 		 556 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  54.41 
 
 		 556 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  56.76 
 
 		 556 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  56.01 
 
 		 557 aa  610  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  50.54 
 
 		 555 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  49.27 
 
 		 558 aa  568  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  49.27 
 
 		 558 aa  568  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  48.65 
 
 		 556 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  50.27 
 
 		 567 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  48.37 
 
 		 555 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  50.27 
 
 		 555 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  48.65 
 
 		 556 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.28 
 
 		 558 aa  536  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  45.96 
 
 		 556 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  46.22 
 
 		 564 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  48.19 
 
 		 560 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  46.22 
 
 		 548 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  46.93 
 
 		 550 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  42.45 
 
 		 546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  43.53 
 
 		 544 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  44.98 
 
 		 548 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  38.39 
 
 		 540 aa  432  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  38.42 
 
 		 544 aa  416  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  41.36 
 
 		 542 aa  416  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  38.17 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 		 557 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  39.53 
 
 		 558 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  37.93 
 
 		 555 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 		 556 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  38.36 
 
 		 558 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.56 
 
 		 557 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  36.86 
 
 		 555 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 		 557 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  37.46 
 
 		 555 aa  364  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  45.3 
 
 		 461 aa  360  4e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  36.65 
 
 		 551 aa  356  5e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  38.78 
 
 		 560 aa  357  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  38.3 
 
 		 551 aa  355  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  38.3 
 
 		 551 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  35.36 
 
 		 558 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  35.64 
 
 		 558 aa  353  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  35.74 
 
 		 558 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  35.2 
 
 		 558 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 		 569 aa  349  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 		 555 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  35.57 
 
 		 555 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  42.35 
 
 		 447 aa  347  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  34.64 
 
 		 554 aa  346  7e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 		 560 aa  345  2e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  39.91 
 
 		 533 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  34 
 
 		 554 aa  341  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  37.61 
 
 		 564 aa  340  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  41.36 
 
 		 559 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  33.87 
 
 		 618 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  36.43 
 
 		 561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  33.09 
 
 		 555 aa  337  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 554 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  40.47 
 
 		 560 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  39.88 
 
 		 572 aa  334  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  35.01 
 
 		 593 aa  334  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 		 553 aa  334  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  37.4 
 
 		 555 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  34.05 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  36.46 
 
 		 558 aa  330  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  36.36 
 
 		 547 aa  330  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  41.73 
 
 		 561 aa  329  9e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  32.55 
 
 		 553 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.98 
 
 		 561 aa  325  9e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  36.28 
 
 		 556 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 		 588 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  37.97 
 
 		 561 aa  325  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 		 588 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  41.12 
 
 		 561 aa  324  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  36.96 
 
 		 556 aa  323  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 		 554 aa  323  4e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  36.09 
 
 		 559 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  36.38 
 
 		 563 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  41.36 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  33.03 
 
 		 652 aa  320  5e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.52 
 
 		 561 aa  320  6e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 		 563 aa  319  9e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000013396 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  31.7 
 
 		 677 aa  318  1e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  41.04 
 
 		 580 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  37.25 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 		 558 aa  318  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0755  beta-lactamase domain protein  36.87 
 
 		 602 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  36.98 
 
 		 558 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>