More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1293 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  62.94 
 
 		 550 aa  681    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 544 aa  1092    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  65.57 
 
 		 546 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  49.82 
 
 		 567 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  46.56 
 
 		 556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  45.86 
 
 		 564 aa  465  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  44.67 
 
 		 560 aa  452  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  44.17 
 
 		 557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  42.99 
 
 		 548 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  43.63 
 
 		 557 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  43.63 
 
 		 557 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  44.17 
 
 		 557 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  43.38 
 
 		 555 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  44.12 
 
 		 556 aa  435  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  43.53 
 
 		 556 aa  428  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  42.42 
 
 		 555 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  44.23 
 
 		 544 aa  424  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.47 
 
 		 557 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  44.09 
 
 		 556 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  42.96 
 
 		 556 aa  422  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  42.91 
 
 		 557 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  43.04 
 
 		 540 aa  413  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  41.02 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  41.27 
 
 		 558 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 		 558 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  41.56 
 
 		 556 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  42.83 
 
 		 557 aa  411  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  41.27 
 
 		 558 aa  411  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  41.02 
 
 		 556 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  38.25 
 
 		 544 aa  404  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  42.37 
 
 		 556 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  42.57 
 
 		 556 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  41.74 
 
 		 556 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 548 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  42.83 
 
 		 556 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  45.76 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  42.34 
 
 		 555 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.59 
 
 		 558 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  46.46 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  41.06 
 
 		 542 aa  378  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  37.16 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  39.82 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.82 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  39.82 
 
 		 556 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  39.27 
 
 		 557 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  38.55 
 
 		 558 aa  363  5.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  39.35 
 
 		 558 aa  363  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 559 aa  360  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  36.61 
 
 		 558 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 		 558 aa  342  9e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  43.99 
 
 		 560 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  35.3 
 
 		 558 aa  339  9e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  35.77 
 
 		 593 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  37.79 
 
 		 533 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  36.91 
 
 		 561 aa  334  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  34.11 
 
 		 555 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 569 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.09 
 
 		 555 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  34.61 
 
 		 558 aa  330  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.26 
 
 		 561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 554 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  34.77 
 
 		 555 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 		 560 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  39.29 
 
 		 561 aa  326  5e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  36.94 
 
 		 562 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  41.36 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  37.08 
 
 		 580 aa  322  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 566 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  36.21 
 
 		 568 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  32.6 
 
 		 645 aa  320  5e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  37.41 
 
 		 595 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  36.22 
 
 		 562 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  33.15 
 
 		 554 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 		 561 aa  317  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 		 590 aa  317  4e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  36.08 
 
 		 561 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  36.26 
 
 		 561 aa  316  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  34.18 
 
 		 551 aa  316  9e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  34.18 
 
 		 551 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.69 
 
 		 561 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 		 559 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 		 561 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  34.95 
 
 		 556 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 		 561 aa  313  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  36.68 
 
 		 572 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  34.79 
 
 		 554 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  37.16 
 
 		 561 aa  313  6.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 		 561 aa  313  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  37.16 
 
 		 565 aa  312  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  32.37 
 
 		 555 aa  312  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  33.27 
 
 		 644 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 		 551 aa  311  2e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 		 556 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  36.43 
 
 		 561 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  32.72 
 
 		 553 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  35.04 
 
 		 561 aa  311  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  36.93 
 
 		 550 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>