More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1070 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  99.82 
 
 		 557 aa  1122    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  56.86 
 
 		 556 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  58.06 
 
 		 556 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  56.01 
 
 		 556 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  59.13 
 
 		 556 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  73.47 
 
 		 556 aa  866    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  56.58 
 
 		 557 aa  651    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 557 aa  1124    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  73.79 
 
 		 557 aa  870    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  57.04 
 
 		 556 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  58.02 
 
 		 556 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  57.94 
 
 		 556 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  81.33 
 
 		 557 aa  927    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  97.13 
 
 		 557 aa  1099    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  56.68 
 
 		 556 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  56.04 
 
 		 557 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  52.35 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  52.37 
 
 		 558 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  52.01 
 
 		 558 aa  581  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  52.01 
 
 		 558 aa  581  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  51.71 
 
 		 555 aa  578  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  51.71 
 
 		 556 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  52.16 
 
 		 555 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  50.45 
 
 		 567 aa  554  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  52.25 
 
 		 556 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.45 
 
 		 558 aa  543  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  45.41 
 
 		 556 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  47.48 
 
 		 560 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  44.36 
 
 		 564 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  45.6 
 
 		 546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  44.62 
 
 		 548 aa  463  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  39.53 
 
 		 540 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  43.19 
 
 		 550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  43.63 
 
 		 544 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  42.93 
 
 		 557 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  39.25 
 
 		 544 aa  437  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  41.76 
 
 		 558 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  39.25 
 
 		 544 aa  429  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  41.45 
 
 		 556 aa  425  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  39.82 
 
 		 555 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  42.83 
 
 		 548 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  42.57 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.57 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  40.43 
 
 		 542 aa  416  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  41.41 
 
 		 558 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  38.94 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  38.72 
 
 		 593 aa  360  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  39.13 
 
 		 547 aa  359  8e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 		 558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  37.84 
 
 		 558 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  39.07 
 
 		 533 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  37.25 
 
 		 558 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  43.11 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  39.93 
 
 		 580 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  35.59 
 
 		 560 aa  349  7e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 		 554 aa  349  8e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 		 566 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  36.4 
 
 		 618 aa  347  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 		 561 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  40.55 
 
 		 558 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  35.18 
 
 		 553 aa  344  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  42.38 
 
 		 447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  40.55 
 
 		 558 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  40.55 
 
 		 558 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  39.32 
 
 		 565 aa  342  7e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  40.86 
 
 		 572 aa  342  8e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 		 555 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 		 554 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  36.06 
 
 		 555 aa  340  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  34.68 
 
 		 555 aa  340  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 553 aa  340  5e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  35.88 
 
 		 644 aa  339  9e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.94 
 
 		 561 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  36.01 
 
 		 558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  34.92 
 
 		 555 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.25 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  35.25 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  39.45 
 
 		 558 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 		 559 aa  336  7.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  37.72 
 
 		 559 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  39.75 
 
 		 561 aa  335  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 		 595 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 		 559 aa  334  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 		 554 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 		 561 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  43.16 
 
 		 560 aa  333  7.000000000000001e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  34.24 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  36.05 
 
 		 554 aa  330  3e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  34.97 
 
 		 554 aa  330  6e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  35.83 
 
 		 569 aa  329  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  39.14 
 
 		 550 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 		 561 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  36.04 
 
 		 556 aa  327  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  39.08 
 
 		 552 aa  326  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12765  hypothetical protein  38.63 
 
 		 558 aa  326  6e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.868415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3999  beta-lactamase domain-containing protein  39.82 
 
 		 558 aa  326  9e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.818404  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 		 550 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  37.14 
 
 		 561 aa  325  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  36.31 
 
 		 556 aa  325  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  36.22 
 
 		 562 aa  324  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>