295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1571 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  100 
 
 
560 aa  1135    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  54.66 
 
 
548 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  53.89 
 
 
567 aa  577  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  50.71 
 
 
556 aa  556  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  51.26 
 
 
564 aa  553  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  48.73 
 
 
556 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  48.37 
 
 
556 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  49.28 
 
 
556 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  48.01 
 
 
557 aa  505  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  46.2 
 
 
556 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  48.02 
 
 
557 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  48.08 
 
 
548 aa  498  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  47.48 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  47.48 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  47.1 
 
 
557 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  47.1 
 
 
556 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  47.25 
 
 
546 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  40.69 
 
 
544 aa  478  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  48.19 
 
 
556 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  44.85 
 
 
555 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  46.84 
 
 
557 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  46.85 
 
 
550 aa  468  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  43.46 
 
 
540 aa  466  9.999999999999999e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  44.93 
 
 
557 aa  465  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  43.88 
 
 
558 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 
558 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  44.44 
 
 
544 aa  462  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  46.74 
 
 
556 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  43.88 
 
 
558 aa  463  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  45.05 
 
 
556 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  45.92 
 
 
556 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.24 
 
 
558 aa  451  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  44.67 
 
 
544 aa  452  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  45.72 
 
 
555 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  43.55 
 
 
556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  44.27 
 
 
556 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  42.68 
 
 
555 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  37.66 
 
 
542 aa  395  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  47.58 
 
 
461 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  40.73 
 
 
565 aa  375  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  37.09 
 
 
555 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  39.19 
 
 
558 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  44.29 
 
 
447 aa  369  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  37.79 
 
 
558 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  44.22 
 
 
440 aa  360  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  39.5 
 
 
595 aa  360  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  37.01 
 
 
558 aa  360  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  40.83 
 
 
561 aa  359  7e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  39.31 
 
 
556 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  37.66 
 
 
557 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.8 
 
 
561 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  36.18 
 
 
558 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  36.76 
 
 
558 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  38.32 
 
 
650 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  39.53 
 
 
559 aa  353  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  36.95 
 
 
558 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  38.48 
 
 
561 aa  352  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  39.14 
 
 
559 aa  351  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  37.52 
 
 
593 aa  351  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  35.91 
 
 
560 aa  350  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  37.48 
 
 
569 aa  350  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  38.17 
 
 
562 aa  349  7e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  35.29 
 
 
555 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 
558 aa  348  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  37.81 
 
 
562 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 
561 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  37.83 
 
 
557 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  37.83 
 
 
557 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  39.34 
 
 
547 aa  346  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  40.7 
 
 
550 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  42.07 
 
 
561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  40.28 
 
 
561 aa  343  5e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  37.84 
 
 
563 aa  343  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  38.24 
 
 
533 aa  343  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  37.91 
 
 
556 aa  342  8e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.01 
 
 
561 aa  342  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  35.74 
 
 
554 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 
568 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  40.62 
 
 
546 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  35.17 
 
 
555 aa  340  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 
580 aa  340  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 
566 aa  340  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  40.44 
 
 
546 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 
566 aa  339  8e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 
563 aa  339  8e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000013396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  35.56 
 
 
554 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  40.59 
 
 
561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1480  beta-lactamase domain protein  40.11 
 
 
561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0694172  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1150  hypothetical protein  38.37 
 
 
675 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.920604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  40.73 
 
 
561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  37.23 
 
 
551 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  36.99 
 
 
560 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  40.89 
 
 
561 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 
554 aa  337  5e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  38.05 
 
 
561 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  40.37 
 
 
564 aa  334  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  34.01 
 
 
553 aa  334  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  37.93 
 
 
561 aa  333  6e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  38.36 
 
 
561 aa  332  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  35.39 
 
 
561 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>