More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2383 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  57.07 
 
 		 556 aa  643    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 556 aa  1108    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  58.35 
 
 		 557 aa  657    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  58.06 
 
 		 557 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  58.06 
 
 		 557 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  72.84 
 
 		 556 aa  825    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  57.89 
 
 		 557 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  55.8 
 
 		 556 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  56.27 
 
 		 557 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  55.43 
 
 		 557 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  55.15 
 
 		 556 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  55.98 
 
 		 556 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  54.17 
 
 		 556 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  55.43 
 
 		 557 aa  591  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  54.17 
 
 		 556 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  51.09 
 
 		 555 aa  579  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  54.35 
 
 		 556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  49.73 
 
 		 558 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  50.18 
 
 		 556 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  49.18 
 
 		 558 aa  559  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  49.18 
 
 		 558 aa  559  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  52.25 
 
 		 555 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  48.73 
 
 		 555 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  50.54 
 
 		 556 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  48.82 
 
 		 567 aa  529  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.44 
 
 		 558 aa  524  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  45.89 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  45.77 
 
 		 564 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  45.92 
 
 		 560 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  42.63 
 
 		 548 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  44.3 
 
 		 550 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  44.09 
 
 		 544 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  43.53 
 
 		 546 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  39.31 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  43.09 
 
 		 548 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  38.35 
 
 		 544 aa  412  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  40.92 
 
 		 542 aa  415  1e-114  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  38.99 
 
 		 544 aa  403  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  38.55 
 
 		 555 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  38.29 
 
 		 556 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  38.85 
 
 		 558 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.76 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  36.84 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  36.86 
 
 		 555 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  37.3 
 
 		 555 aa  363  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  39.84 
 
 		 560 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  37 
 
 		 558 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  36.35 
 
 		 558 aa  350  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 		 558 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  36.64 
 
 		 558 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  35.8 
 
 		 555 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.33 
 
 		 555 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  43.12 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  34.76 
 
 		 555 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  34.62 
 
 		 677 aa  341  2e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 		 551 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 		 554 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  36.88 
 
 		 563 aa  340  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  38.29 
 
 		 554 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  38.81 
 
 		 555 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  38.91 
 
 		 551 aa  339  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  38.91 
 
 		 551 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 		 572 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  36.71 
 
 		 593 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.42 
 
 		 561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  36.07 
 
 		 554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  40.25 
 
 		 533 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  45.39 
 
 		 560 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  37.06 
 
 		 569 aa  336  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  37.12 
 
 		 563 aa  336  7.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000013396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 		 561 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  35.55 
 
 		 554 aa  333  5e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 		 560 aa  333  6e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  34.68 
 
 		 652 aa  333  6e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  36.87 
 
 		 556 aa  332  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 618 aa  331  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 595 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  37.75 
 
 		 547 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1887  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.94 
 
 		 717 aa  330  5.0000000000000004e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.441469  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  41.28 
 
 		 559 aa  330  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 559 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  40.94 
 
 		 561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 		 562 aa  326  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  37.42 
 
 		 553 aa  326  8.000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 		 562 aa  326  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  36.99 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 		 568 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 552 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  33.7 
 
 		 573 aa  325  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  37.03 
 
 		 556 aa  324  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  40.36 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 		 551 aa  325  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  36.58 
 
 		 561 aa  324  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  40.29 
 
 		 561 aa  324  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  33.16 
 
 		 553 aa  324  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  32.49 
 
 		 645 aa  324  3e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  39.92 
 
 		 588 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>