More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1276 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  65.77 
 
 		 558 aa  768    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  60.11 
 
 		 558 aa  714    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  65.59 
 
 		 558 aa  766    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 556 aa  1122    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  80.4 
 
 		 555 aa  939    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  66.61 
 
 		 555 aa  734    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  65.77 
 
 		 558 aa  768    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  96.22 
 
 		 556 aa  1082    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  76.98 
 
 		 555 aa  907    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  52.78 
 
 		 556 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  53.42 
 
 		 556 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  51.17 
 
 		 556 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  52.42 
 
 		 556 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  52.25 
 
 		 557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  52.24 
 
 		 556 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  52.25 
 
 		 557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  51.53 
 
 		 556 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  50.54 
 
 		 557 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  51.53 
 
 		 557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  51.44 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  50.81 
 
 		 556 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  50.45 
 
 		 567 aa  559  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  50.18 
 
 		 557 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  50.54 
 
 		 556 aa  551  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  50.72 
 
 		 557 aa  542  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  48.65 
 
 		 556 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  44.86 
 
 		 556 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  44.52 
 
 		 564 aa  488  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  44.27 
 
 		 560 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  41.98 
 
 		 548 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  42.75 
 
 		 548 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  42.83 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  41.47 
 
 		 550 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  42.21 
 
 		 546 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  40.22 
 
 		 555 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  37.18 
 
 		 544 aa  393  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  37.43 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  40.46 
 
 		 557 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  40.89 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  39 
 
 		 558 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  38.96 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  40.93 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.93 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  40.12 
 
 		 544 aa  372  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 		 542 aa  371  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  42.95 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  38.3 
 
 		 558 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  44.72 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 		 558 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  39.62 
 
 		 533 aa  362  9e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  36.74 
 
 		 558 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  36.43 
 
 		 555 aa  362  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  35.69 
 
 		 555 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 558 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  38.07 
 
 		 560 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  36.33 
 
 		 555 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.69 
 
 		 555 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  36.46 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 593 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  35.4 
 
 		 553 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  37.48 
 
 		 555 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  38.81 
 
 		 554 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  35.27 
 
 		 555 aa  343  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 		 566 aa  342  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 		 560 aa  340  4e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 		 559 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 		 551 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  35.51 
 
 		 551 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  40.14 
 
 		 440 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  35.34 
 
 		 551 aa  336  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  37.07 
 
 		 553 aa  336  7.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 		 618 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 		 561 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 		 569 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 		 650 aa  334  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 		 554 aa  333  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 554 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  42.45 
 
 		 560 aa  332  9e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  36.25 
 
 		 559 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  35.12 
 
 		 548 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  37.79 
 
 		 565 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  37.33 
 
 		 561 aa  329  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 		 561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 		 572 aa  327  3e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  37.01 
 
 		 561 aa  326  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  35.28 
 
 		 564 aa  326  7e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 		 551 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  38.41 
 
 		 644 aa  323  5e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  36.43 
 
 		 595 aa  323  6e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 568 aa  322  9.000000000000001e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 		 550 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  34.97 
 
 		 557 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.57 
 
 		 561 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  34.68 
 
 		 554 aa  321  1.9999999999999998e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  36.07 
 
 		 566 aa  321  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 		 562 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 		 562 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  35.91 
 
 		 561 aa  319  7e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  38.13 
 
 		 550 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  36.46 
 
 		 561 aa  319  9e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>