More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3001 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  63.9 
 
 		 550 aa  706    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  65.57 
 
 		 544 aa  732    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 546 aa  1098    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  49.36 
 
 		 567 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  46.93 
 
 		 556 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  48.57 
 
 		 564 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  48.17 
 
 		 560 aa  488  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  46.68 
 
 		 557 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  45.6 
 
 		 557 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  45.6 
 
 		 557 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  47.02 
 
 		 556 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  45.78 
 
 		 557 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  43.66 
 
 		 548 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  43.09 
 
 		 556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  45.96 
 
 		 557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.88 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  43.17 
 
 		 556 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  44.95 
 
 		 556 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  42.57 
 
 		 556 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  42.21 
 
 		 556 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  43.65 
 
 		 544 aa  431  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  43.63 
 
 		 556 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 		 540 aa  428  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  43.3 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  44.34 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  43.35 
 
 		 558 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  42.73 
 
 		 557 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  42.67 
 
 		 548 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  43.35 
 
 		 558 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  42.18 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  42.52 
 
 		 558 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  41.34 
 
 		 555 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  40.36 
 
 		 544 aa  411  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  42.39 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  42.45 
 
 		 555 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  42.21 
 
 		 556 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  38.35 
 
 		 542 aa  394  1e-108  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.29 
 
 		 558 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  40.22 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  38.78 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.29 
 
 		 557 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  40.29 
 
 		 557 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  38.17 
 
 		 558 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  38.99 
 
 		 556 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  42.7 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  37.21 
 
 		 558 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  45.43 
 
 		 461 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  36.86 
 
 		 558 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  37.27 
 
 		 558 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  35.88 
 
 		 555 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  36.51 
 
 		 555 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 558 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 		 569 aa  340  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 		 593 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  42.99 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  40.48 
 
 		 560 aa  336  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 		 560 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  36.82 
 
 		 533 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  36.45 
 
 		 561 aa  329  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  35.33 
 
 		 551 aa  329  7e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  35.33 
 
 		 551 aa  329  8e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 		 554 aa  329  8e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.53 
 
 		 561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  35.33 
 
 		 551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  34.73 
 
 		 554 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  33.27 
 
 		 553 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  34.01 
 
 		 558 aa  323  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  36.18 
 
 		 561 aa  323  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  36.25 
 
 		 550 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  32.96 
 
 		 677 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  33.58 
 
 		 555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  33.77 
 
 		 555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  38.96 
 
 		 546 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  38.22 
 
 		 550 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  38.96 
 
 		 546 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  37.33 
 
 		 561 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  36.95 
 
 		 580 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 		 554 aa  317  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  37.2 
 
 		 559 aa  317  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 		 561 aa  316  9e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  36.95 
 
 		 595 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  36.53 
 
 		 561 aa  314  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 563 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  35.4 
 
 		 564 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  36.01 
 
 		 561 aa  313  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  33.95 
 
 		 553 aa  312  9e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  36.03 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 		 559 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 		 618 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1821  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 		 576 aa  311  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120027  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  36.82 
 
 		 568 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  35.62 
 
 		 644 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  34.73 
 
 		 572 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  35.67 
 
 		 563 aa  310  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 		 563 aa  310  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000013396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  36.04 
 
 		 650 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  33.71 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>