284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2870 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  91.01 
 
 		 556 aa  1026    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  57.4 
 
 		 557 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  80.04 
 
 		 557 aa  923    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  57.76 
 
 		 557 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  94.24 
 
 		 556 aa  1059    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  81.65 
 
 		 556 aa  912    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  100 
 
 		 556 aa  1122    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  80.58 
 
 		 557 aa  916    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  57.25 
 
 		 557 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  57.94 
 
 		 557 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  62.3 
 
 		 556 aa  690    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  80.58 
 
 		 556 aa  936    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  57.01 
 
 		 556 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  56.34 
 
 		 557 aa  626  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  53.78 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  52.87 
 
 		 558 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  52.69 
 
 		 558 aa  609  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  52.69 
 
 		 558 aa  609  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  56.88 
 
 		 556 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  54.17 
 
 		 567 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  51.98 
 
 		 555 aa  594  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  52.06 
 
 		 556 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  52.24 
 
 		 556 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  54.35 
 
 		 556 aa  579  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  54 
 
 		 555 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.36 
 
 		 558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  49.28 
 
 		 560 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  46.04 
 
 		 564 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  46.13 
 
 		 556 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  45.42 
 
 		 548 aa  488  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  42.08 
 
 		 540 aa  464  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  44.93 
 
 		 548 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  44.49 
 
 		 544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  45.29 
 
 		 550 aa  448  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  40.61 
 
 		 544 aa  430  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  43.3 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  42.57 
 
 		 544 aa  423  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  38.38 
 
 		 542 aa  399  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  40.92 
 
 		 558 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  40.15 
 
 		 558 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  39.31 
 
 		 555 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  39.21 
 
 		 557 aa  389  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  39.61 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.61 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 		 556 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  46.12 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  37.84 
 
 		 558 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  42.08 
 
 		 447 aa  360  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  37.12 
 
 		 551 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  37.3 
 
 		 551 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  36.94 
 
 		 551 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  39.38 
 
 		 547 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 		 561 aa  356  7.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  43.08 
 
 		 440 aa  352  8.999999999999999e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  37.55 
 
 		 644 aa  348  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  37.43 
 
 		 593 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  39.67 
 
 		 554 aa  346  7e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  41.2 
 
 		 572 aa  345  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  36.31 
 
 		 554 aa  344  2e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 569 aa  345  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 		 558 aa  343  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  37.96 
 
 		 553 aa  343  5e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  38.93 
 
 		 559 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  37.68 
 
 		 556 aa  342  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  36.15 
 
 		 558 aa  342  7e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  37.27 
 
 		 533 aa  342  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  36.25 
 
 		 558 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  43.4 
 
 		 560 aa  339  9e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  36.68 
 
 		 631 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  35.14 
 
 		 555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.97 
 
 		 561 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  34.59 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 		 566 aa  336  7e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 		 558 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 		 555 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 554 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 		 553 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  36.99 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  37.48 
 
 		 563 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  38.78 
 
 		 562 aa  331  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  39.51 
 
 		 550 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 		 554 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 		 562 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  39.6 
 
 		 590 aa  330  6e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  37.16 
 
 		 556 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  34.77 
 
 		 555 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  33.45 
 
 		 652 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  39.88 
 
 		 561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  39.64 
 
 		 546 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  38.52 
 
 		 553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  38.86 
 
 		 568 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 		 546 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  37.14 
 
 		 564 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 		 554 aa  326  5e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  34.59 
 
 		 555 aa  326  6e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  37.86 
 
 		 563 aa  326  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 		 595 aa  325  9e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 		 556 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  34.36 
 
 		 556 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12765  hypothetical protein  39.29 
 
 		 558 aa  324  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.868415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>