More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0018 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  87.93 
 
 		 662 aa  1153    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 652 aa  1345    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1887  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  79.73 
 
 		 717 aa  1008    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.441469  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  71.82 
 
 		 677 aa  952    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0063  beta-lactamase domain protein  72.25 
 
 		 664 aa  903    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2089  hypothetical protein  57.8 
 
 		 647 aa  800    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  79.76 
 
 		 573 aa  977    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  87.93 
 
 		 662 aa  1158    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  87.15 
 
 		 662 aa  1153    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  74.15 
 
 		 645 aa  998    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  45.99 
 
 		 560 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  44.67 
 
 		 555 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  44.53 
 
 		 555 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  42.39 
 
 		 553 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  41.89 
 
 		 558 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  44.34 
 
 		 559 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  42.31 
 
 		 593 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  42.36 
 
 		 554 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  42.15 
 
 		 555 aa  485  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  42.15 
 
 		 555 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  42.81 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  43.19 
 
 		 555 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  42.39 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  41.61 
 
 		 558 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  42.19 
 
 		 569 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  41.86 
 
 		 558 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  41.45 
 
 		 553 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  41.86 
 
 		 558 aa  475  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  41.64 
 
 		 560 aa  473  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  39.19 
 
 		 547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  41.01 
 
 		 533 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 		 554 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.11 
 
 		 564 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  40.47 
 
 		 555 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 554 aa  457  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  40.43 
 
 		 561 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  41.42 
 
 		 618 aa  452  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  40.51 
 
 		 566 aa  448  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3608  hypothetical protein  40.68 
 
 		 589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  39.75 
 
 		 557 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 		 549 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  40.64 
 
 		 565 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  40.64 
 
 		 565 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  39.75 
 
 		 551 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  40.43 
 
 		 560 aa  437  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.92 
 
 		 557 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0755  beta-lactamase domain protein  41.79 
 
 		 602 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2917  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.94 
 
 		 591 aa  436  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  38.99 
 
 		 557 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  38.81 
 
 		 557 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  38.81 
 
 		 557 aa  435  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.89 
 
 		 555 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.95 
 
 		 557 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.56 
 
 		 557 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  38.11 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  38.45 
 
 		 557 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21201  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.48 
 
 		 649 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  41.07 
 
 		 588 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.63 
 
 		 557 aa  432  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  38.48 
 
 		 555 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  41.07 
 
 		 588 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  39.67 
 
 		 551 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.69 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  39.11 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1250  hypothetical protein  42.28 
 
 		 644 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  39.85 
 
 		 551 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1846  hypothetical protein  39.78 
 
 		 609 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17781  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.3 
 
 		 662 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.23805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  38.32 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  38.86 
 
 		 561 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0589  hypothetical protein  40.64 
 
 		 596 aa  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  39.57 
 
 		 559 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.87 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  39.11 
 
 		 555 aa  426  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.11 
 
 		 555 aa  426  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.11 
 
 		 555 aa  426  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0069  hypothetical protein  42.25 
 
 		 679 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  39.11 
 
 		 555 aa  426  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 		 555 aa  426  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 		 569 aa  425  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  39.49 
 
 		 551 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18421  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  43.86 
 
 		 667 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 		 555 aa  426  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 		 556 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00741  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.39 
 
 		 667 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192171 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  38.29 
 
 		 561 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 557 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18421  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  37.85 
 
 		 661 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  35.75 
 
 		 550 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4360  beta-lactamase domain protein  43.65 
 
 		 583 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263724  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 		 555 aa  422  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  38.48 
 
 		 548 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 		 556 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18611  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  37.85 
 
 		 662 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  38.32 
 
 		 561 aa  422  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>