285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3283 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  80.04 
 
 		 557 aa  920    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  57.07 
 
 		 557 aa  658    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 556 aa  1122    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  89.93 
 
 		 556 aa  1012    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  81.65 
 
 		 556 aa  907    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  91.01 
 
 		 556 aa  1005    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  81.12 
 
 		 557 aa  914    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  57.91 
 
 		 556 aa  661    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  56.86 
 
 		 557 aa  649    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  81.65 
 
 		 556 aa  944    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  63.73 
 
 		 556 aa  700    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  56.68 
 
 		 557 aa  648    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  56.32 
 
 		 557 aa  645    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  54.5 
 
 		 555 aa  628  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  56.34 
 
 		 557 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  53.33 
 
 		 558 aa  614  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  53.33 
 
 		 558 aa  614  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  53.33 
 
 		 558 aa  609  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  57.07 
 
 		 556 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  52.88 
 
 		 555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  52.6 
 
 		 556 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  52.78 
 
 		 556 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  54.38 
 
 		 555 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  54.17 
 
 		 556 aa  585  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  52.72 
 
 		 567 aa  583  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.54 
 
 		 558 aa  578  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  48.37 
 
 		 560 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  45.68 
 
 		 564 aa  500  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  45.05 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  45.6 
 
 		 548 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  40.8 
 
 		 540 aa  449  1e-125  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  44.93 
 
 		 548 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  44.32 
 
 		 550 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  40.67 
 
 		 544 aa  434  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  40.29 
 
 		 544 aa  431  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  42.57 
 
 		 546 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  41.02 
 
 		 544 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  41.17 
 
 		 558 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  38.59 
 
 		 542 aa  395  1e-108  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  39.17 
 
 		 558 aa  389  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  38.8 
 
 		 555 aa  388  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  39.82 
 
 		 557 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  38.84 
 
 		 556 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  45.89 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.39 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  43.76 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  41.63 
 
 		 447 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  37.61 
 
 		 558 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  38.98 
 
 		 551 aa  347  3e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  38.98 
 
 		 551 aa  347  4e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  36.38 
 
 		 561 aa  346  6e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  38.78 
 
 		 551 aa  346  8e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 		 556 aa  345  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  38.98 
 
 		 554 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 		 559 aa  343  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  37.59 
 
 		 593 aa  342  8e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  38.95 
 
 		 547 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  40.17 
 
 		 572 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  36.43 
 
 		 558 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 558 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 		 569 aa  335  9e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  36.68 
 
 		 558 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  35.74 
 
 		 644 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  35.42 
 
 		 555 aa  334  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  36.93 
 
 		 533 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  36.73 
 
 		 553 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37 
 
 		 561 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  42.45 
 
 		 560 aa  330  4e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 554 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 		 554 aa  329  6e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  40 
 
 		 550 aa  330  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  36.2 
 
 		 555 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 566 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  37.01 
 
 		 631 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  36.85 
 
 		 555 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  39.19 
 
 		 546 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  36.99 
 
 		 560 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  37.89 
 
 		 563 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.36 
 
 		 564 aa  327  5e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  37.59 
 
 		 553 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.61 
 
 		 555 aa  326  6e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 		 554 aa  325  9e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  38.9 
 
 		 546 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  35.42 
 
 		 555 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  36.1 
 
 		 556 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 		 558 aa  325  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  40.42 
 
 		 590 aa  324  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  35.04 
 
 		 554 aa  323  6e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2016  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.22 
 
 		 578 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0968063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  39.34 
 
 		 556 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 560 aa  320  3e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 		 557 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  38.9 
 
 		 556 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  38.9 
 
 		 556 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 		 561 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  38.9 
 
 		 556 aa  320  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  38.9 
 
 		 556 aa  320  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  38.9 
 
 		 556 aa  320  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  38.9 
 
 		 556 aa  320  6e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>