More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3342 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  57.66 
 
 		 548 aa  651    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 548 aa  1100    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  54.66 
 
 		 560 aa  590  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  50.45 
 
 		 567 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  47.83 
 
 		 564 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 556 aa  488  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  46.31 
 
 		 557 aa  478  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  47.39 
 
 		 556 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  45.42 
 
 		 556 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  43.92 
 
 		 558 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  44.28 
 
 		 558 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  44.28 
 
 		 558 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  45.42 
 
 		 556 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  43.99 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  45.6 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  44.62 
 
 		 557 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  44.62 
 
 		 557 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  44.88 
 
 		 557 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  46.22 
 
 		 556 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  42.13 
 
 		 555 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  43.58 
 
 		 555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  44.7 
 
 		 557 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.15 
 
 		 558 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  43.37 
 
 		 556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  43.57 
 
 		 550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  39.23 
 
 		 540 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  42.99 
 
 		 544 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  43.53 
 
 		 546 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  44.17 
 
 		 556 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  38.89 
 
 		 544 aa  442  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  44.28 
 
 		 557 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  42.27 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  42.06 
 
 		 556 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  44.34 
 
 		 555 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  42.63 
 
 		 556 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  38.48 
 
 		 544 aa  422  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  41.98 
 
 		 556 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  38.45 
 
 		 542 aa  390  1e-107  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  46.77 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  38.22 
 
 		 555 aa  382  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  37.27 
 
 		 551 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  37.38 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  37.27 
 
 		 551 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  37.45 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  38.67 
 
 		 557 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 		 558 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 		 558 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  38.09 
 
 		 556 aa  362  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  38.85 
 
 		 557 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  38.85 
 
 		 557 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 		 558 aa  360  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  36.21 
 
 		 558 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  42.44 
 
 		 560 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  37.34 
 
 		 593 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 		 569 aa  356  6.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  37.36 
 
 		 558 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 		 618 aa  350  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  42.02 
 
 		 561 aa  346  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  42.07 
 
 		 440 aa  346  8e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  40.04 
 
 		 550 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  37.94 
 
 		 559 aa  343  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  39.53 
 
 		 561 aa  342  8e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  35.24 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 553 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 		 562 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 		 562 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  39.96 
 
 		 565 aa  340  5e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  38.08 
 
 		 561 aa  339  7e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  39.52 
 
 		 546 aa  339  9e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  36.07 
 
 		 533 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  33.27 
 
 		 560 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  39.52 
 
 		 546 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.43 
 
 		 561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 		 650 aa  338  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 		 561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  36.26 
 
 		 564 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  35.01 
 
 		 554 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  34.01 
 
 		 554 aa  335  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 566 aa  333  6e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 		 550 aa  332  9e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  33.15 
 
 		 555 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  40.29 
 
 		 561 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 		 554 aa  330  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  34.06 
 
 		 662 aa  330  4e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  34.13 
 
 		 554 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  34.24 
 
 		 662 aa  330  5.0000000000000004e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 		 568 aa  330  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  35.5 
 
 		 547 aa  330  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  33.64 
 
 		 553 aa  329  7e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  34.5 
 
 		 555 aa  329  8e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  34.06 
 
 		 662 aa  329  8e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 		 558 aa  329  9e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  37.91 
 
 		 595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  39.64 
 
 		 561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  32.91 
 
 		 555 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.09 
 
 		 561 aa  326  6e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  37.43 
 
 		 561 aa  326  8.000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>