295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1872 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  56.58 
 
 		 557 aa  651    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  56.37 
 
 		 557 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  56.01 
 
 		 557 aa  651    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 		 557 aa  1115    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  56.4 
 
 		 557 aa  650    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  79.14 
 
 		 556 aa  904    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  81.12 
 
 		 556 aa  897    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  80.04 
 
 		 556 aa  894    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  91.74 
 
 		 557 aa  1012    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  57.37 
 
 		 556 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  80.04 
 
 		 556 aa  905    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  83.75 
 
 		 556 aa  956    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  61.98 
 
 		 556 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  56.4 
 
 		 557 aa  629  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  53.65 
 
 		 558 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  52.92 
 
 		 558 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  52.08 
 
 		 555 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  52.92 
 
 		 558 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  55.83 
 
 		 556 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  55.43 
 
 		 556 aa  587  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  53.47 
 
 		 555 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  50.63 
 
 		 555 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  50.9 
 
 		 556 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  51.45 
 
 		 567 aa  562  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  48.55 
 
 		 558 aa  561  1e-158  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  50.54 
 
 		 556 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  48.01 
 
 		 560 aa  505  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  46.13 
 
 		 556 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  45.8 
 
 		 564 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  46.31 
 
 		 548 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  41.3 
 
 		 540 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  42.83 
 
 		 544 aa  445  1e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  45.47 
 
 		 548 aa  445  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  44.34 
 
 		 550 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  42.7 
 
 		 546 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  39.39 
 
 		 544 aa  426  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  42.47 
 
 		 544 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  38.2 
 
 		 542 aa  402  1e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  40.77 
 
 		 556 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  39.34 
 
 		 555 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 		 558 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  39.71 
 
 		 558 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.14 
 
 		 557 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  40.14 
 
 		 557 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  46.85 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  37.61 
 
 		 558 aa  356  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  42.66 
 
 		 447 aa  350  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  36.89 
 
 		 554 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  38.45 
 
 		 547 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  36.98 
 
 		 561 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  39.59 
 
 		 558 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 		 560 aa  348  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  36.87 
 
 		 551 aa  348  2e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  36.69 
 
 		 551 aa  347  4e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 		 553 aa  346  6e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 		 551 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 		 553 aa  343  5e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 		 558 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  38.43 
 
 		 555 aa  342  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  35.04 
 
 		 566 aa  342  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 		 593 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  36.62 
 
 		 644 aa  341  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.75 
 
 		 561 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  36.4 
 
 		 558 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 		 533 aa  339  9e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  38.32 
 
 		 554 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  37.19 
 
 		 631 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  42.18 
 
 		 440 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  36.93 
 
 		 558 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 554 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  36.12 
 
 		 554 aa  334  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  38.41 
 
 		 563 aa  334  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  36.71 
 
 		 555 aa  334  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 		 569 aa  334  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 		 590 aa  333  6e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  38.63 
 
 		 559 aa  333  6e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 		 595 aa  332  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 		 555 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  38.31 
 
 		 568 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  36.08 
 
 		 554 aa  330  3e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.7 
 
 		 555 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 		 555 aa  330  6e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  40.08 
 
 		 572 aa  329  8e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 650 aa  328  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  42.92 
 
 		 560 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  38.87 
 
 		 565 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  34.54 
 
 		 560 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2016  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.06 
 
 		 578 aa  327  5e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0968063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  38.29 
 
 		 553 aa  326  6e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  33.7 
 
 		 677 aa  325  1e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  37.52 
 
 		 555 aa  325  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  39.88 
 
 		 588 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  35.77 
 
 		 556 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.73 
 
 		 564 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  39.88 
 
 		 588 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  37.47 
 
 		 591 aa  323  4e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  38.08 
 
 		 580 aa  323  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  35.77 
 
 		 556 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>