More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1194 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 557 aa  1122    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 		 557 aa  1122    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  63.83 
 
 		 558 aa  715    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  66.85 
 
 		 555 aa  770    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  94.61 
 
 		 557 aa  1082    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  66.43 
 
 		 556 aa  743    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  68.77 
 
 		 558 aa  778    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  42.57 
 
 		 557 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  42.57 
 
 		 557 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  41.3 
 
 		 557 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  43.53 
 
 		 567 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  41.77 
 
 		 556 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  43.56 
 
 		 557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  41.86 
 
 		 558 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  40.65 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  42.04 
 
 		 558 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  41.86 
 
 		 558 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  41.22 
 
 		 555 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.14 
 
 		 557 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  39.34 
 
 		 556 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  39.1 
 
 		 556 aa  381  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  40.59 
 
 		 556 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  39.93 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  40.22 
 
 		 556 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  39.32 
 
 		 556 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  40.26 
 
 		 557 aa  375  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  40.57 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  39.86 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  39.93 
 
 		 556 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  39.82 
 
 		 544 aa  372  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  41.85 
 
 		 555 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  38.85 
 
 		 548 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 		 556 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 		 556 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  39.56 
 
 		 556 aa  362  8e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  40.93 
 
 		 556 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 		 564 aa  360  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  35.42 
 
 		 544 aa  358  1.9999999999999998e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  37.83 
 
 		 560 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  38.93 
 
 		 550 aa  352  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.43 
 
 		 558 aa  349  9e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  36.04 
 
 		 542 aa  333  7.000000000000001e-90  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  32.36 
 
 		 544 aa  332  1e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 		 548 aa  331  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  31.45 
 
 		 540 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  39.93 
 
 		 550 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  39.93 
 
 		 546 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  39.75 
 
 		 546 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 		 560 aa  309  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 		 559 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  33.93 
 
 		 555 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  32.92 
 
 		 677 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  34.52 
 
 		 593 aa  300  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  32.2 
 
 		 645 aa  300  5e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  33.58 
 
 		 558 aa  300  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 555 aa  299  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  41.63 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  33.27 
 
 		 555 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  33.39 
 
 		 555 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  31.7 
 
 		 573 aa  293  5e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 		 580 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 		 554 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0096  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 		 550 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.458831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  38.72 
 
 		 560 aa  287  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 618 aa  286  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1887  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.95 
 
 		 717 aa  286  8e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.441469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  36.85 
 
 		 553 aa  286  9e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  35.76 
 
 		 554 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 		 447 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  31.12 
 
 		 652 aa  281  2e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  33.21 
 
 		 644 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  36.29 
 
 		 555 aa  281  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 		 558 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  35.22 
 
 		 557 aa  280  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  30.73 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  32.44 
 
 		 561 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  35.65 
 
 		 547 aa  280  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  35.22 
 
 		 558 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  35.22 
 
 		 558 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  35.22 
 
 		 558 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  34.91 
 
 		 565 aa  279  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 662 aa  279  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 		 554 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 662 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  35.55 
 
 		 551 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.54 
 
 		 557 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 560 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  35.97 
 
 		 551 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 662 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.33 
 
 		 557 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 558 aa  277  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  33.39 
 
 		 561 aa  277  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  35.34 
 
 		 551 aa  276  5e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 		 558 aa  276  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 554 aa  276  6e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 		 556 aa  276  8e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0063  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 664 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 590 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>