More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01020 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 440 aa  907    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  57.89 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  46.26 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  43.24 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  44.22 
 
 		 560 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  43.57 
 
 		 564 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  43.76 
 
 		 556 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  42.07 
 
 		 548 aa  346  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 548 aa  343  5e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  40.77 
 
 		 555 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.18 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 		 546 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  42.63 
 
 		 556 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  40.82 
 
 		 556 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  43.08 
 
 		 556 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  40.14 
 
 		 556 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  42.27 
 
 		 556 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  40.14 
 
 		 556 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  40.8 
 
 		 556 aa  329  6e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  42.14 
 
 		 555 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  40.23 
 
 		 558 aa  326  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  40.23 
 
 		 558 aa  326  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  41.95 
 
 		 557 aa  325  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  39.64 
 
 		 555 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  40.68 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  41.36 
 
 		 544 aa  324  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  40.33 
 
 		 560 aa  322  9.000000000000001e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  42.63 
 
 		 556 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  40.99 
 
 		 550 aa  320  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  39.05 
 
 		 544 aa  313  3.9999999999999997e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  39.3 
 
 		 557 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.88 
 
 		 558 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  41.36 
 
 		 556 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  37.53 
 
 		 542 aa  306  6e-82  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  39.67 
 
 		 556 aa  306  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  37.79 
 
 		 540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  38.86 
 
 		 556 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  37.09 
 
 		 544 aa  297  2e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  36.28 
 
 		 558 aa  293  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  35.6 
 
 		 558 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  40.61 
 
 		 557 aa  289  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  37.11 
 
 		 554 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  38.17 
 
 		 557 aa  286  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 		 554 aa  285  8e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  36.79 
 
 		 558 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  34.78 
 
 		 555 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35 
 
 		 555 aa  282  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  36.52 
 
 		 533 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  37.47 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  37.47 
 
 		 557 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  35 
 
 		 555 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 		 554 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 558 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  33.88 
 
 		 560 aa  278  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 		 561 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 		 555 aa  276  7e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  35.52 
 
 		 593 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 560 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  34.89 
 
 		 618 aa  273  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  36.36 
 
 		 555 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 		 559 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  34.77 
 
 		 569 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  37.38 
 
 		 556 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  35.93 
 
 		 553 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.87 
 
 		 561 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  34.68 
 
 		 555 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.33 
 
 		 557 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 554 aa  266  7e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.11 
 
 		 557 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  33.11 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  33.95 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  34.01 
 
 		 590 aa  264  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  33.11 
 
 		 557 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  33.94 
 
 		 564 aa  262  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  32.88 
 
 		 557 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  34.23 
 
 		 558 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  33.89 
 
 		 555 aa  261  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  36.34 
 
 		 550 aa  261  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  35.44 
 
 		 556 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  33.02 
 
 		 557 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 		 591 aa  261  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  34.26 
 
 		 566 aa  260  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.65 
 
 		 557 aa  260  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  36.08 
 
 		 551 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.43 
 
 		 557 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 		 557 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 		 561 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 		 561 aa  259  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.28 
 
 		 555 aa  259  9e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  35.35 
 
 		 561 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  36.47 
 
 		 559 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  35.49 
 
 		 561 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 		 551 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09390  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  35.87 
 
 		 560 aa  258  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.293183  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  33.49 
 
 		 551 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  35.28 
 
 		 555 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  33.87 
 
 		 547 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  33.49 
 
 		 551 aa  257  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  35.03 
 
 		 555 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>