254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4168 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4168  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
318 aa  636    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  37.85 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 
348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  37 
 
 
340 aa  165  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  35.58 
 
 
330 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 
320 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
339 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 
322 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
314 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
332 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
327 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  33.01 
 
 
351 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
329 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
324 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 
331 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  29.28 
 
 
354 aa  89.7  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 
310 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 
368 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  25.77 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  27.74 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  29.68 
 
 
331 aa  79  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 
325 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  23.78 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  22.29 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  28.45 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 
862 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  31.27 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  23.84 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.87 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
355 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 
366 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  28.62 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  25.96 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  27.97 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3406  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.317826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  25.91 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  25.91 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  28.05 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  28.05 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  25.55 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  25.91 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  25.91 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
205 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  28.38 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  25.18 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 
231 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  25.55 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  26.6 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  28.84 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 
354 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 
303 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 
205 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 
354 aa  59.3  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  26.82 
 
 
211 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
205 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 
361 aa  57.4  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  27.33 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
228 aa  56.6  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
316 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
231 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
318 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  26.65 
 
 
359 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 
344 aa  56.2  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  27 
 
 
207 aa  56.2  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 
297 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  24.03 
 
 
343 aa  55.8  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 
304 aa  55.8  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0657  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 
207 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
218 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.7 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  29.14 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.72 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  26.98 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 
205 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>