131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1310 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1310  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
193 aa  407  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4498  beta-lactamase domain-containing protein  35.36 
 
 
194 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4497  beta-lactamase domain-containing protein  34.25 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000128242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0460  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516875  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  23.44 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  27.36 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  26.29 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05310  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.19 
 
 
238 aa  62.8  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 
252 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  25.36 
 
 
285 aa  60.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  29.44 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 
242 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 
321 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  23.41 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
307 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 
303 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 
226 aa  52.4  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 
243 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  23.77 
 
 
246 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
208 aa  52  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 
263 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 
294 aa  51.2  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  23.56 
 
 
339 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15960  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.77 
 
 
269 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 
324 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  26.06 
 
 
309 aa  48.5  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  28.36 
 
 
295 aa  48.5  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  24.21 
 
 
291 aa  48.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1402  glyoxalase II  29.25 
 
 
277 aa  48.1  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.701553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
213 aa  48.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 
205 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0912  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.330922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 
288 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 
324 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 
291 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 
497 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  42.37 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0123  beta-lactamase-like  25.41 
 
 
199 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.998731  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 
233 aa  46.6  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 
281 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  40.68 
 
 
279 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 
497 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  22.61 
 
 
278 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  40.32 
 
 
281 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  40.32 
 
 
281 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
332 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 
321 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 
312 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
213 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
297 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  28 
 
 
878 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  28 
 
 
878 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 
209 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 
329 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  23.28 
 
 
500 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 
231 aa  45.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  32.63 
 
 
294 aa  45.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  34.43 
 
 
328 aa  44.7  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  27.59 
 
 
207 aa  44.7  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 
305 aa  44.7  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
310 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  26.9 
 
 
285 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  25.14 
 
 
283 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  26.21 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  22.68 
 
 
232 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  25.52 
 
 
296 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  20.81 
 
 
290 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  27.49 
 
 
285 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.92 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 
325 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  21.05 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  23.32 
 
 
297 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  23.78 
 
 
276 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 
231 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 
287 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  26.9 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 
223 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
256 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0122  beta-lactamase-like  24.29 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.151592  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  27.74 
 
 
209 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  37.29 
 
 
279 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  22.01 
 
 
252 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  24.48 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  27.97 
 
 
264 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  21.46 
 
 
299 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 
328 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>