46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1798 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1798  beta-lactamase-like  100 
 
 
306 aa  609  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3335  beta-lactamase domain-containing protein  35.76 
 
 
311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593309  normal  0.179661 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  27.48 
 
 
253 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  32.68 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  27.98 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  24.62 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  27.38 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  21.72 
 
 
261 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 
261 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  24.66 
 
 
250 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  24.66 
 
 
250 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  24.66 
 
 
250 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.66 
 
 
250 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 
324 aa  46.2  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  25.79 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  24.66 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 
211 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09027  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  24.2 
 
 
250 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  28.21 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  29.71 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.83 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
330 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 
312 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  27.71 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 
279 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  23.74 
 
 
250 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  25.28 
 
 
282 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 
264 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 
330 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  28.57 
 
 
238 aa  42.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>