50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3705 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  954    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  81.17 
 
 		 494 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  37.76 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  35.45 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  38.23 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  38.98 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  39.82 
 
 		 506 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  29.75 
 
 		 565 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  33.7 
 
 		 567 aa  93.2  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  30 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  23.86 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  24.25 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  23.86 
 
 		 516 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4105  putative mannosyltransferase  29.61 
 
 		 526 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  23.66 
 
 		 516 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  26.65 
 
 		 516 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  30.61 
 
 		 616 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  27.85 
 
 		 618 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  22.9 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  31.8 
 
 		 536 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  31.06 
 
 		 618 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1008  hypothetical protein  30.52 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0217006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  28.13 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  21.59 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  26.16 
 
 		 607 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  22.59 
 
 		 510 aa  53.9  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  30.71 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 592 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  28.41 
 
 		 658 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  26.49 
 
 		 532 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  33.58 
 
 		 546 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  26.02 
 
 		 526 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  27.52 
 
 		 546 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  27.52 
 
 		 546 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  34.45 
 
 		 727 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 513 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0769  hypothetical protein  38.93 
 
 		 590 aa  47.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0333554  hitchhiker  0.00590563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  30.33 
 
 		 588 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  26.38 
 
 		 533 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  31.86 
 
 		 726 aa  47  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  25.77 
 
 		 533 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3642  hypothetical protein  29.69 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.741716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  32.46 
 
 		 704 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  30.25 
 
 		 638 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  27.19 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  36.11 
 
 		 544 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1177  beta-lactamase domain-containing protein  48.89 
 
 		 98 aa  43.9  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  24.4 
 
 		 517 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>