15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3642 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3642  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  881    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.741716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  25.59 
 
 		 618 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  26.7 
 
 		 506 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 506 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  27.82 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  20.24 
 
 		 507 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  26.45 
 
 		 531 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  27.02 
 
 		 726 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  32.74 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 513 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  22.19 
 
 		 510 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  23.7 
 
 		 516 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  29.31 
 
 		 727 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  23.52 
 
 		 516 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>