30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1008 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1008  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  941    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0217006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  35.28 
 
 		 565 aa  154  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  32.18 
 
 		 526 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4105  putative mannosyltransferase  32.32 
 
 		 526 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  30.38 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  31.93 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  29.04 
 
 		 486 aa  76.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  35.5 
 
 		 567 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  29.69 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  29.42 
 
 		 536 aa  68.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  30.98 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  32.43 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  27.89 
 
 		 618 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  27.21 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  36.76 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  21.16 
 
 		 507 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  23.01 
 
 		 658 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  31.15 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  27.75 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  22.78 
 
 		 516 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  35.82 
 
 		 616 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  22.78 
 
 		 516 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  22.56 
 
 		 516 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2971  membrane-like protein  27.59 
 
 		 544 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0765391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  28.48 
 
 		 516 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  22.78 
 
 		 516 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 510 aa  44.3  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  26.15 
 
 		 704 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  22.86 
 
 		 532 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>