32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0862 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  869    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  53.98 
 
 		 478 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  34.72 
 
 		 494 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  35.23 
 
 		 508 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  30.95 
 
 		 486 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  29.25 
 
 		 565 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  31 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  35.14 
 
 		 567 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  31.14 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  38.35 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  29.77 
 
 		 618 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4105  putative mannosyltransferase  30.6 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  27.57 
 
 		 658 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  27.72 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  26.48 
 
 		 531 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  21.65 
 
 		 507 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  34.46 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  23.59 
 
 		 516 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  24.09 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  23.36 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  23.96 
 
 		 516 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  24.05 
 
 		 516 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1008  hypothetical protein  29.35 
 
 		 504 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0217006 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  21.09 
 
 		 531 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  32.95 
 
 		 492 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  24.76 
 
 		 726 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 510 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  27.25 
 
 		 616 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  39.36 
 
 		 564 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 729 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3642  hypothetical protein  28.5 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.741716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>