40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1913 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1913  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
528 aa  1075    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3252  glycosyl transferase family 39  39.18 
 
 
522 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2869  glycosyl transferase family 39  39.18 
 
 
522 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0447081  normal  0.0253035 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1621  glycosyltransferase  27.93 
 
 
539 aa  88.2  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.240459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3865  hypothetical protein  26.72 
 
 
860 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.460325 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  25.36 
 
 
531 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
513 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3251  hypothetical protein  31.43 
 
 
151 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2870  hypothetical protein  31.43 
 
 
151 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136655  normal  0.0370011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4300  hypothetical protein  25.32 
 
 
869 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3056  hypothetical protein  25.37 
 
 
719 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  35.79 
 
 
536 aa  61.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
510 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1122  hypothetical protein  28.69 
 
 
680 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.180103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.51 
 
 
780 aa  53.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4658  family 39 glycosyl transferase  28.89 
 
 
544 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  30.47 
 
 
655 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
694 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  29.76 
 
 
541 aa  50.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09561  hypothetical protein  33.58 
 
 
549 aa  50.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.241955  normal  0.10067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 
553 aa  50.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0286  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  32.84 
 
 
549 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.19601  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1439  hypothetical protein  25.97 
 
 
540 aa  48.5  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3825  hypothetical protein  28.48 
 
 
959 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  34.12 
 
 
575 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1913  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransf erase  28.7 
 
 
653 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.954673  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  31.34 
 
 
836 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  28.26 
 
 
658 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  33.03 
 
 
606 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0442  hypothetical protein  23.33 
 
 
826 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.186794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0029  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
687 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.642435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
483 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  32.77 
 
 
534 aa  44.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  46.34 
 
 
582 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  40.68 
 
 
553 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
476 aa  44.3  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
719 aa  44.3  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  27.03 
 
 
466 aa  43.9  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  35.64 
 
 
541 aa  43.9  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  29.45 
 
 
515 aa  43.5  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>