69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0829 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  100 
 
 		 697 aa  1365    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1938  glycosyl transferase family 39  51.85 
 
 		 635 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  46.31 
 
 		 719 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5251  glycosyl transferase family 39  43.18 
 
 		 747 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4427  glycosyl transferase family protein  44.84 
 
 		 626 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0319  glycosyl transferase family protein  53.83 
 
 		 795 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2279  glycosyl transferase family protein  46.85 
 
 		 700 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.286519  decreased coverage  0.00538135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  42.17 
 
 		 701 aa  402  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6499  glycosyl transferase family protein  52.23 
 
 		 753 aa  389  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945206  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0437  glycosyl transferase family 39  46 
 
 		 746 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0143  glycosyl transferase family 39  43.67 
 
 		 678 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1924  glycosyl transferase family 39  49.27 
 
 		 670 aa  353  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3939  glycosyl transferase family protein  49.13 
 
 		 621 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3924  glycosyl transferase family protein  49.13 
 
 		 621 aa  348  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.73215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3998  glycosyl transferase family protein  49.13 
 
 		 621 aa  348  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.618428  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3143  glycosyl transferase family 39  38.33 
 
 		 634 aa  346  8e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2390  glycosyl transferase family protein  49.04 
 
 		 685 aa  330  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267497  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  47.16 
 
 		 641 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  34.49 
 
 		 629 aa  326  7e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  32.36 
 
 		 635 aa  309  9e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4425  glycosyl transferase family protein  46.19 
 
 		 628 aa  301  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  40.89 
 
 		 655 aa  295  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0901  glycosyl transferase family 39  55.78 
 
 		 843 aa  286  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438692  normal  0.261805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3108  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  35.08 
 
 		 562 aa  266  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 669 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0748  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 784 aa  243  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4311  glycosyl transferase family 39  28.74 
 
 		 687 aa  236  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  44.41 
 
 		 655 aa  235  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 		 694 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1332  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 717 aa  232  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6394  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  48.02 
 
 		 756 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0101  glycosyltransferase  30.77 
 
 		 700 aa  194  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1597  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 718 aa  174  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0514449  normal  0.160515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5911  glycosyl transferase family 39  30.57 
 
 		 644 aa  170  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.871376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3937  glycosyl transferase family protein  49.09 
 
 		 622 aa  99  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3996  glycosyl transferase family protein  49.09 
 
 		 622 aa  99  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0580758  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3922  glycosyl transferase family protein  49.09 
 
 		 622 aa  99  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2269  glycosyl transferase family protein  48.11 
 
 		 628 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2952  hypothetical protein  46.51 
 
 		 230 aa  82.4  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2877  hypothetical protein  39.24 
 
 		 276 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  24.53 
 
 		 534 aa  56.2  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 582 aa  55.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  40 
 
 		 2914 aa  53.1  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 603 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 554 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  26.63 
 
 		 466 aa  52  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 585 aa  51.6  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  29.79 
 
 		 528 aa  51.2  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1146 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  29.45 
 
 		 527 aa  49.3  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  45.59 
 
 		 2851 aa  48.9  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  27.88 
 
 		 515 aa  48.9  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  24.85 
 
 		 575 aa  47.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1163 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  45.83 
 
 		 606 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 553 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3121  glycosyl transferase family 39  26.36 
 
 		 577 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  28.48 
 
 		 582 aa  45.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  25.81 
 
 		 622 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  25.81 
 
 		 622 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 		 477 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 586 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  26.74 
 
 		 575 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 601 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  25.22 
 
 		 812 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  25 
 
 		 565 aa  44.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  28.74 
 
 		 1391 aa  44.3  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4658  family 39 glycosyl transferase  25.2 
 
 		 544 aa  44.3  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.68 
 
 		 864 aa  43.9  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>