94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2279 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2279  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
700 aa  1335    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.286519  decreased coverage  0.00538135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  81.84 
 
 
719 aa  905    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5251  glycosyl transferase family 39  49.86 
 
 
747 aa  528  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4427  glycosyl transferase family protein  49.92 
 
 
626 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0319  glycosyl transferase family protein  59.92 
 
 
795 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  47.04 
 
 
701 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6499  glycosyl transferase family protein  61.79 
 
 
753 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945206  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1924  glycosyl transferase family 39  48.13 
 
 
670 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1938  glycosyl transferase family 39  52.95 
 
 
635 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  49.91 
 
 
697 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  58.33 
 
 
641 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0143  glycosyl transferase family 39  50.4 
 
 
678 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3939  glycosyl transferase family protein  58.24 
 
 
621 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3998  glycosyl transferase family protein  58.24 
 
 
621 aa  376  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.618428  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3924  glycosyl transferase family protein  58.24 
 
 
621 aa  376  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.73215  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3143  glycosyl transferase family 39  43.7 
 
 
634 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3922  glycosyl transferase family protein  57.18 
 
 
622 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3996  glycosyl transferase family protein  57.18 
 
 
622 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0580758  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3937  glycosyl transferase family protein  56.95 
 
 
622 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2390  glycosyl transferase family protein  55.38 
 
 
685 aa  352  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267497  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4425  glycosyl transferase family protein  57.08 
 
 
628 aa  351  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6394  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  45.68 
 
 
756 aa  336  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  48.77 
 
 
655 aa  333  6e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  36.9 
 
 
629 aa  321  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2269  glycosyl transferase family protein  50.78 
 
 
628 aa  320  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  34.2 
 
 
635 aa  316  9e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0901  glycosyl transferase family 39  60.87 
 
 
843 aa  283  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438692  normal  0.261805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3108  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  37.76 
 
 
562 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
694 aa  241  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4311  glycosyl transferase family 39  29.79 
 
 
687 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5911  glycosyl transferase family 39  34.63 
 
 
644 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.871376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  46.72 
 
 
655 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  40.22 
 
 
669 aa  195  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1597  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
718 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0514449  normal  0.160515 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0101  glycosyltransferase  38.41 
 
 
700 aa  173  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1332  glycosyl transferase family protein  38.64 
 
 
717 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0748  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 
784 aa  171  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0437  glycosyl transferase family 39  60.5 
 
 
746 aa  146  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2952  hypothetical protein  44.57 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2877  hypothetical protein  48.68 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  39.86 
 
 
603 aa  61.2  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
574 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
574 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
582 aa  55.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  38.26 
 
 
527 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  27.69 
 
 
574 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  25.74 
 
 
565 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4658  family 39 glycosyl transferase  24.69 
 
 
544 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  31.65 
 
 
1146 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0809  hypothetical protein  33.56 
 
 
580 aa  51.6  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.01 
 
 
864 aa  51.6  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.07 
 
 
563 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
586 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  34.07 
 
 
563 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
573 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  29.76 
 
 
575 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0725  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
609 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  33.05 
 
 
1163 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
585 aa  48.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
554 aa  48.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3882  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
574 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3975  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
574 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4085  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
574 aa  47.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.42 
 
 
601 aa  47.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  28.93 
 
 
519 aa  47.8  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  27.98 
 
 
574 aa  47.4  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.59 
 
 
505 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 
505 aa  47.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 
477 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  26.29 
 
 
323 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  29.61 
 
 
556 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  25.84 
 
 
580 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  26.02 
 
 
466 aa  46.6  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  33.61 
 
 
575 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  30.99 
 
 
556 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1910  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  29.25 
 
 
306 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
601 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  29.32 
 
 
514 aa  45.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  31.3 
 
 
528 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  31.71 
 
 
573 aa  45.8  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  26.32 
 
 
618 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
483 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
636 aa  45.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1976  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
541 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.167644  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  27.5 
 
 
541 aa  44.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  33.06 
 
 
565 aa  44.7  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.82 
 
 
496 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
565 aa  44.7  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
514 aa  44.3  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  22.4 
 
 
534 aa  44.3  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14261  glycosyltransferase  27.44 
 
 
555 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.259667  hitchhiker  0.00324745 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1913  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransf erase  35.29 
 
 
653 aa  44.3  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.954673  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  30.43 
 
 
516 aa  44.3  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  31.3 
 
 
515 aa  44.3  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>