114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1938 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1938  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
635 aa  1233    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4427  glycosyl transferase family protein  49.28 
 
 
626 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3924  glycosyl transferase family protein  50.95 
 
 
621 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.73215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3998  glycosyl transferase family protein  50.95 
 
 
621 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.618428  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3939  glycosyl transferase family protein  50.63 
 
 
621 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2279  glycosyl transferase family protein  49.1 
 
 
700 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.286519  decreased coverage  0.00538135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0319  glycosyl transferase family protein  54.62 
 
 
795 aa  442  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  43.98 
 
 
701 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3922  glycosyl transferase family protein  47.3 
 
 
622 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3996  glycosyl transferase family protein  47.3 
 
 
622 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0580758  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3937  glycosyl transferase family protein  47.3 
 
 
622 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0437  glycosyl transferase family 39  53.68 
 
 
746 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4425  glycosyl transferase family protein  45.99 
 
 
628 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  55.4 
 
 
719 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5251  glycosyl transferase family 39  45.9 
 
 
747 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2269  glycosyl transferase family protein  46.67 
 
 
628 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  36.04 
 
 
629 aa  357  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0143  glycosyl transferase family 39  44.71 
 
 
678 aa  354  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1924  glycosyl transferase family 39  50.99 
 
 
670 aa  352  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  55.17 
 
 
641 aa  346  7e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2390  glycosyl transferase family protein  51.72 
 
 
685 aa  345  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267497  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3143  glycosyl transferase family 39  41.94 
 
 
634 aa  341  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  34.38 
 
 
635 aa  319  9e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  44.47 
 
 
655 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6394  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  37.72 
 
 
756 aa  298  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
669 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0901  glycosyl transferase family 39  59.68 
 
 
843 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438692  normal  0.261805 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1332  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
717 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3108  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  38.16 
 
 
562 aa  259  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4311  glycosyl transferase family 39  31.01 
 
 
687 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0101  glycosyltransferase  29.06 
 
 
700 aa  242  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  47.14 
 
 
655 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
694 aa  221  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5911  glycosyl transferase family 39  33.33 
 
 
644 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.871376 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1597  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
718 aa  176  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0514449  normal  0.160515 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0748  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
784 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6499  glycosyl transferase family protein  57.76 
 
 
753 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945206  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  53.77 
 
 
697 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2952  hypothetical protein  47.22 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2877  hypothetical protein  43.42 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
585 aa  63.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
574 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  36.76 
 
 
603 aa  62  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
574 aa  60.8  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
586 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
554 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  29.08 
 
 
574 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  26.94 
 
 
574 aa  57.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  26.89 
 
 
563 aa  57  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.3 
 
 
864 aa  56.6  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 
601 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
564 aa  55.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  30.05 
 
 
1146 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  31.94 
 
 
582 aa  54.7  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
582 aa  54.7  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3975  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
574 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
573 aa  54.3  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  32.09 
 
 
575 aa  54.3  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3882  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
574 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4085  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
574 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
553 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
553 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1913  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransf erase  30.56 
 
 
653 aa  53.5  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.954673  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  21.5 
 
 
534 aa  53.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  24.73 
 
 
580 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  29.77 
 
 
563 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.77 
 
 
563 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
582 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  30.67 
 
 
509 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  31.88 
 
 
575 aa  52  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  24.52 
 
 
466 aa  51.6  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  34.95 
 
 
622 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  34.95 
 
 
622 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.84 
 
 
601 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  34.41 
 
 
606 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  28.36 
 
 
498 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  26.71 
 
 
541 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
509 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
526 aa  48.9  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.09 
 
 
568 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  29.1 
 
 
323 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  33.04 
 
 
527 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  28.7 
 
 
812 aa  48.5  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  32.86 
 
 
578 aa  48.5  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  28.68 
 
 
565 aa  48.5  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 
565 aa  48.5  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.09 
 
 
576 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.09 
 
 
576 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.09 
 
 
576 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.09 
 
 
576 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.09 
 
 
553 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.09 
 
 
568 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  32.37 
 
 
489 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
600 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  24.88 
 
 
516 aa  47.8  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0114  hypothetical protein  30.17 
 
 
587 aa  47.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.112922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  32.33 
 
 
585 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0809  hypothetical protein  34.68 
 
 
580 aa  47.4  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  27.82 
 
 
573 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  31.63 
 
 
611 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>